18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_3764 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_3764  Entericidin EcnAB  100 
 
 		 43 aa  85.9  2e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3942  Entericidin EcnAB  95.35 
 
 		 43 aa  80.9  0.000000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.579921  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0414  entericidin EcnAB  65.12 
 
 		 43 aa  65.5  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000617218 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0335  entericidin B membrane lipoprotein  58.14 
 
 		 48 aa  50.4  0.000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000300433 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3863  entericidin B membrane lipoprotein  55.81 
 
 		 48 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.20506 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03981  hypothetical protein  55.81 
 
 		 48 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5665  entericidin B membrane lipoprotein  55.81 
 
 		 48 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.118402 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4679  entericidin B membrane lipoprotein  55.81 
 
 		 48 aa  48.5  0.00003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4618  entericidin B membrane lipoprotein  55.81 
 
 		 48 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.161287 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04019  entericidin B membrane lipoprotein  55.81 
 
 		 48 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4391  entericidin B membrane lipoprotein  55.81 
 
 		 48 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3843  Entericidin EcnAB  55.81 
 
 		 48 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5477  entericidin EcnAB  51.35 
 
 		 44 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.525479  normal  0.114102 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4806  entericidin EcnAB  51.35 
 
 		 44 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.256769  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3561  entericidin EcnAB  51.35 
 
 		 44 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.878172  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2002  entericidin EcnAB  48.65 
 
 		 43 aa  41.2  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.764034  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4708  entericidin EcnAB  51.35 
 
 		 44 aa  41.2  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.350137  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4186  entericidin EcnAB  51.35 
 
 		 44 aa  41.2  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>