10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1172 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_1172  entericidin EcnAB  100 
 
 
49 aa  99.8  1e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.814112  normal  0.506463 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0239  Entericidin EcnAB  48.89 
 
 
45 aa  48.1  0.00004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2234  lipoprotein transmembrane  48.89 
 
 
44 aa  47.4  0.00007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.30503  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2631  entericidin EcnAB  47.73 
 
 
44 aa  46.6  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4284  bacteriolytic lipoprotein entericidin AB  50 
 
 
47 aa  45.4  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3815  entericidin EcnAB  64.52 
 
 
58 aa  44.7  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.823038  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1254  Entericidin EcnAB  60.53 
 
 
46 aa  42  0.003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.250301 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0151  Entericidin EcnAB  48.65 
 
 
46 aa  41.6  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2947  entericidin EcnAB  44.44 
 
 
43 aa  41.2  0.005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00524222  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0143  Entericidin EcnAB  39.53 
 
 
46 aa  40.8  0.007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>