15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A2313 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A2313  entericidin EcnAB  100 
 
 		 42 aa  83.2  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.54288  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2474  entericidin EcnAB  78.05 
 
 		 44 aa  65.1  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.222579  normal  0.376001 
 
 
-
 
NC_003296  RS03154  lipoprotein transmembrane  65 
 
 		 46 aa  47  0.00008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.801084  normal  0.170965 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4173  Entericidin EcnAB  65 
 
 		 46 aa  45.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.653132  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4285  Entericidin EcnAB  65 
 
 		 46 aa  45.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.542737 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0290  entericidin precursor lipoprotein  62.5 
 
 		 46 aa  43.1  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3815  entericidin EcnAB  51.22 
 
 		 58 aa  42.4  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.823038  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1920  entericidin EcnAB  46.34 
 
 		 41 aa  42.4  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2631  entericidin EcnAB  50 
 
 		 44 aa  42  0.003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4284  bacteriolytic lipoprotein entericidin AB  48.78 
 
 		 47 aa  42  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0239  Entericidin EcnAB  51.16 
 
 		 45 aa  42  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0143  Entericidin EcnAB  60 
 
 		 46 aa  41.2  0.005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0151  Entericidin EcnAB  60 
 
 		 46 aa  40.8  0.007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2234  lipoprotein transmembrane  45.24 
 
 		 44 aa  40  0.01  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.30503  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5236  entericidin EcnAB  57.14 
 
 		 41 aa  40  0.01  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.539123 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>