11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_5236 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_5236  entericidin EcnAB  100 
 
 
41 aa  83.2  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.539123 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3230  entericidin EcnAB  86.96 
 
 
40 aa  45.1  0.0004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.128329  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2583  Entericidin EcnAB  86.96 
 
 
40 aa  45.1  0.0004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.703183  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0057  entericidin EcnAB  56.1 
 
 
71 aa  43.9  0.0008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.398438 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1920  entericidin EcnAB  55.17 
 
 
41 aa  43.1  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1394  Entericidin EcnAB  43.59 
 
 
44 aa  42  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00584084  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3119  entericidin EcnAB  51.22 
 
 
47 aa  41.6  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00124679 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0875  entericidin EcnAB  47.5 
 
 
43 aa  41.2  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.309715 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1868  Entericidin EcnAB  52.94 
 
 
68 aa  41.2  0.005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.545291 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3289  hypothetical protein  47.37 
 
 
39 aa  40.4  0.008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  5.9992600000000004e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2313  entericidin EcnAB  57.14 
 
 
42 aa  40  0.01  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.54288  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>