53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A2195 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A2195  Phage transcriptional activator, Ogr/Delta  100 
 
 		 97 aa  199  9.999999999999999e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3117  transcriptional activator Ogr/delta  65.91 
 
 		 88 aa  120  8e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0964  putative bacteriophage transcriptional activator-related transcription regulator protein  80.3 
 
 		 73 aa  118  3e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.809217  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1904  putative transcriptional activator transcription regulator protein  47.46 
 
 		 82 aa  70.1  0.00000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00444501  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0173  transcriptional activator Ogr/delta  51.67 
 
 		 82 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4868  transcriptional activator Ogr/delta  50 
 
 		 82 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.547602  normal  0.181017 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1628  transcriptional activator Ogr/delta  45 
 
 		 106 aa  62.8  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.350137  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2583  transcriptional activator Ogr/delta  45 
 
 		 107 aa  62.8  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.000206926  hitchhiker  0.0000460899 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2617  transcriptional activator Ogr/delta  45 
 
 		 107 aa  62.8  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00204522  hitchhiker  0.000000000237412 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0741  putative phage zinc-binding transcriptional activator  44.78 
 
 		 77 aa  59.7  0.00000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1360  phage transcriptional activator, Ogr/delta  56.25 
 
 		 71 aa  57.4  0.00000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2106  transcriptional activator Ogr/delta  48.21 
 
 		 64 aa  54.7  0.0000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0144545  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2939  zinc-finger protein  40.58 
 
 		 89 aa  54.3  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  decreased coverage  6.930430000000001e-29 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2353  transcriptional activator Ogr/delta  44.64 
 
 		 71 aa  53.5  0.0000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000465197  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2306  transcriptional activator Ogr/delta  44.64 
 
 		 71 aa  53.5  0.0000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.580847  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2194  phage transcriptional activator, Ogr/Delta  44.64 
 
 		 71 aa  53.5  0.0000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1808  transcriptional activator Ogr/delta  44.64 
 
 		 63 aa  53.1  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.00000910407  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2750  transcriptional activator Ogr/delta  44.64 
 
 		 72 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00364612 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2486  phage transcriptional activator, Ogr/Delta  44.64 
 
 		 72 aa  53.1  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0949  phage transcriptional activator, Ogr/Delta  44.64 
 
 		 72 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.429231  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00857  hypothetical protein  44.64 
 
 		 83 aa  53.5  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00851  prophage P2 OGR-like protein  44.64 
 
 		 83 aa  53.5  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0237  transcriptional activator Ogr/delta  37.8 
 
 		 80 aa  52.4  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000439463  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1475  phage transcriptional activator, Ogr/delta  36.71 
 
 		 79 aa  52.4  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0527212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0856  transcriptional activator Ogr/delta  40.58 
 
 		 72 aa  50.8  0.000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.0000000000414293  hitchhiker  0.000248698 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2802  zinc-finger protein  43.64 
 
 		 89 aa  50.8  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1361  hypothetical protein  32.5 
 
 		 87 aa  50.4  0.000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3475  DNA-binding transcriptional regulator  46.43 
 
 		 72 aa  50.1  0.000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.100837  normal  0.103795 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2888  transcriptional activator Ogr/delta  44 
 
 		 88 aa  50.4  0.000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05018  hypothetical protein  34.25 
 
 		 83 aa  49.7  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0718  phage transcriptional activator, Ogr/delta  42.19 
 
 		 82 aa  50.1  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0220217 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0358  phage transcriptional activator Ogr/delta  42.86 
 
 		 90 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0718  transcriptional activator Ogr/delta  41.82 
 
 		 82 aa  48.5  0.00003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4132  hypothetical protein  40.68 
 
 		 87 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2769  phage transcriptional activator, Ogr/delta  37.33 
 
 		 80 aa  47.8  0.00005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.278918  normal  0.680282 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3704  transcriptional activator Ogr/delta  40.68 
 
 		 87 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.04056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1733  phage transcriptional activator, Ogr/delta  40.68 
 
 		 87 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.000208403  normal  0.718201 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0895  transcriptional activator Ogr/delta  35.48 
 
 		 88 aa  47.4  0.00007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.646461  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0692  phage transcriptional activator, Ogr/delta  40 
 
 		 81 aa  47.4  0.00007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1278  phage transcriptional activator, Ogr/delta  40 
 
 		 82 aa  47  0.00008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1860  transcriptional activator Ogr/delta  38.98 
 
 		 91 aa  47  0.00009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0672856  normal  0.0226752 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4151  putative transcriptional regulator  31.25 
 
 		 81 aa  46.6  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.202641  normal  0.022006 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2956  phage transcriptional activator, Ogr/delta  40.68 
 
 		 81 aa  47  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000761798 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3277  transcriptional activator Ogr/delta  38.18 
 
 		 82 aa  46.2  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0050  transcriptional activator Ogr/delta  40.68 
 
 		 80 aa  44.7  0.0005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3104  phage transcriptional activator, Ogr/delta  37.1 
 
 		 87 aa  44.3  0.0006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.203632 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3023  DNA-binding transcriptional regulator  41.67 
 
 		 84 aa  43.5  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0341467 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2666  transcriptional activator Ogr/delta  36.21 
 
 		 80 aa  43.5  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.058976  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3199  transcriptional activator Ogr/delta  39.58 
 
 		 72 aa  43.1  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.00001944  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4352  DNA-binding transcriptional regulator  41.67 
 
 		 72 aa  42.7  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.481473 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0999  DNA-binding transcriptional regulator  41.67 
 
 		 72 aa  42.7  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.603449  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1574  transcriptional activator Ogr/delta  41.67 
 
 		 72 aa  42.7  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3319  phage transcriptional activator, Ogr/delta  28.74 
 
 		 141 aa  40.4  0.008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.359919  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>