17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_1361 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007963  Csal_1361  hypothetical protein  100 
 
 		 87 aa  182  2.0000000000000003e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1628  transcriptional activator Ogr/delta  44.87 
 
 		 106 aa  68.2  0.00000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.350137  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2583  transcriptional activator Ogr/delta  44.87 
 
 		 107 aa  67.8  0.00000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.000206926  hitchhiker  0.0000460899 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2617  transcriptional activator Ogr/delta  44.87 
 
 		 107 aa  67.8  0.00000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00204522  hitchhiker  0.000000000237412 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1860  transcriptional activator Ogr/delta  42.86 
 
 		 91 aa  67  0.00000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0672856  normal  0.0226752 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4132  hypothetical protein  42.86 
 
 		 87 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1733  phage transcriptional activator, Ogr/delta  42.86 
 
 		 87 aa  65.5  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.000208403  normal  0.718201 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3704  transcriptional activator Ogr/delta  42.86 
 
 		 87 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.04056  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4868  transcriptional activator Ogr/delta  42.86 
 
 		 82 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.547602  normal  0.181017 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1904  putative transcriptional activator transcription regulator protein  39.68 
 
 		 82 aa  55.5  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00444501  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3117  transcriptional activator Ogr/delta  39.39 
 
 		 88 aa  52.4  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0173  transcriptional activator Ogr/delta  39.68 
 
 		 82 aa  52.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2195  Phage transcriptional activator, Ogr/Delta  32.5 
 
 		 97 aa  50.4  0.000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1362  bacteriophage-acquired protein  34.67 
 
 		 85 aa  49.3  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.150393  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0964  putative bacteriophage transcriptional activator-related transcription regulator protein  36.51 
 
 		 73 aa  47.4  0.00006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.809217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2888  transcriptional activator Ogr/delta  30.65 
 
 		 88 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05018  hypothetical protein  26.87 
 
 		 83 aa  41.6  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>