14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_1733 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_1733  phage transcriptional activator, Ogr/delta  100 
 
 		 87 aa  183  5e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.000208403  normal  0.718201 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4132  hypothetical protein  98.85 
 
 		 87 aa  181  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3704  transcriptional activator Ogr/delta  96.55 
 
 		 87 aa  177  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.04056  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1860  transcriptional activator Ogr/delta  92.21 
 
 		 91 aa  156  1e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0672856  normal  0.0226752 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1361  hypothetical protein  42.86 
 
 		 87 aa  65.5  0.0000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4868  transcriptional activator Ogr/delta  43.28 
 
 		 82 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.547602  normal  0.181017 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1904  putative transcriptional activator transcription regulator protein  38.24 
 
 		 82 aa  56.2  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00444501  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0173  transcriptional activator Ogr/delta  41.79 
 
 		 82 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3117  transcriptional activator Ogr/delta  42.37 
 
 		 88 aa  49.3  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2195  Phage transcriptional activator, Ogr/Delta  40.68 
 
 		 97 aa  47.8  0.00005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1628  transcriptional activator Ogr/delta  35.71 
 
 		 106 aa  46.6  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.350137  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0964  putative bacteriophage transcriptional activator-related transcription regulator protein  42.86 
 
 		 73 aa  46.2  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.809217  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2583  transcriptional activator Ogr/delta  35.71 
 
 		 107 aa  45.8  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.000206926  hitchhiker  0.0000460899 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2617  transcriptional activator Ogr/delta  35.71 
 
 		 107 aa  45.8  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00204522  hitchhiker  0.000000000237412 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>