27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_2888 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009997  Sbal195_2888  transcriptional activator Ogr/delta  100 
 
 		 88 aa  181  4.0000000000000006e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1628  transcriptional activator Ogr/delta  38.96 
 
 		 106 aa  62  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.350137  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2617  transcriptional activator Ogr/delta  37.66 
 
 		 107 aa  60.8  0.000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00204522  hitchhiker  0.000000000237412 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2583  transcriptional activator Ogr/delta  37.66 
 
 		 107 aa  60.8  0.000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.000206926  hitchhiker  0.0000460899 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3117  transcriptional activator Ogr/delta  48 
 
 		 88 aa  53.9  0.0000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0964  putative bacteriophage transcriptional activator-related transcription regulator protein  39.71 
 
 		 73 aa  52.8  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.809217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2195  Phage transcriptional activator, Ogr/Delta  44 
 
 		 97 aa  50.4  0.000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1808  transcriptional activator Ogr/delta  39.22 
 
 		 63 aa  47  0.00008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.00000910407  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2106  transcriptional activator Ogr/delta  37.25 
 
 		 64 aa  45.4  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0144545  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3023  DNA-binding transcriptional regulator  37.74 
 
 		 84 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0341467 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4352  DNA-binding transcriptional regulator  38.78 
 
 		 72 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.481473 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2353  transcriptional activator Ogr/delta  35.29 
 
 		 71 aa  44.3  0.0006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000465197  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2306  transcriptional activator Ogr/delta  35.29 
 
 		 71 aa  44.3  0.0006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.580847  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0999  DNA-binding transcriptional regulator  38.78 
 
 		 72 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.603449  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2194  phage transcriptional activator, Ogr/Delta  35.29 
 
 		 71 aa  44.3  0.0006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00857  hypothetical protein  36.54 
 
 		 83 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00851  prophage P2 OGR-like protein  36.54 
 
 		 83 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2486  phage transcriptional activator, Ogr/Delta  36.54 
 
 		 72 aa  43.9  0.0007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1574  transcriptional activator Ogr/delta  38.78 
 
 		 72 aa  43.9  0.0007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2750  transcriptional activator Ogr/delta  36.54 
 
 		 72 aa  43.9  0.0007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00364612 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0949  phage transcriptional activator, Ogr/Delta  36.54 
 
 		 72 aa  43.9  0.0007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.429231  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0741  putative phage zinc-binding transcriptional activator  42 
 
 		 77 aa  42.7  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1360  phage transcriptional activator, Ogr/delta  38.46 
 
 		 71 aa  42.7  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1361  hypothetical protein  30.65 
 
 		 87 aa  42  0.003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1904  putative transcriptional activator transcription regulator protein  40 
 
 		 82 aa  42  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00444501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3475  DNA-binding transcriptional regulator  36.73 
 
 		 72 aa  41.2  0.005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.100837  normal  0.103795 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3199  transcriptional activator Ogr/delta  39.22 
 
 		 72 aa  41.2  0.005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.00001944  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>