34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_2353 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_2353  transcriptional activator Ogr/delta  100 
 
 		 71 aa  149  1e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000465197  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2194  phage transcriptional activator, Ogr/Delta  98.59 
 
 		 71 aa  147  4e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2306  transcriptional activator Ogr/delta  98.59 
 
 		 71 aa  147  4e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.580847  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00851  prophage P2 OGR-like protein  65.71 
 
 		 83 aa  98.6  2e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00857  hypothetical protein  65.71 
 
 		 83 aa  98.6  2e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2486  phage transcriptional activator, Ogr/Delta  65.71 
 
 		 72 aa  98.6  3e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2750  transcriptional activator Ogr/delta  65.71 
 
 		 72 aa  98.6  3e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00364612 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0949  phage transcriptional activator, Ogr/Delta  65.71 
 
 		 72 aa  98.6  3e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.429231  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3023  DNA-binding transcriptional regulator  60.56 
 
 		 84 aa  95.9  2e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0341467 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4352  DNA-binding transcriptional regulator  60.56 
 
 		 72 aa  95.5  2e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.481473 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0999  DNA-binding transcriptional regulator  60.56 
 
 		 72 aa  95.5  2e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.603449  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1574  transcriptional activator Ogr/delta  60.56 
 
 		 72 aa  94.7  4e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1360  phage transcriptional activator, Ogr/delta  65.08 
 
 		 71 aa  92.8  1e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3199  transcriptional activator Ogr/delta  53.52 
 
 		 72 aa  87.4  6e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.00001944  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3475  DNA-binding transcriptional regulator  56.34 
 
 		 72 aa  85.9  2e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.100837  normal  0.103795 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2106  transcriptional activator Ogr/delta  65.52 
 
 		 64 aa  85.5  2e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0144545  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0856  transcriptional activator Ogr/delta  57.97 
 
 		 72 aa  85.1  3e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.0000000000414293  hitchhiker  0.000248698 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1808  transcriptional activator Ogr/delta  65.52 
 
 		 63 aa  84.3  5e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.00000910407  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3104  phage transcriptional activator, Ogr/delta  46.3 
 
 		 87 aa  58.5  0.00000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.203632 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4151  putative transcriptional regulator  44.23 
 
 		 81 aa  56.2  0.0000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.202641  normal  0.022006 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3277  transcriptional activator Ogr/delta  53.33 
 
 		 82 aa  55.1  0.0000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0718  transcriptional activator Ogr/delta  48.89 
 
 		 82 aa  54.3  0.0000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3117  transcriptional activator Ogr/delta  38.24 
 
 		 88 aa  53.9  0.0000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2195  Phage transcriptional activator, Ogr/Delta  44.64 
 
 		 97 aa  53.5  0.0000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0741  putative phage zinc-binding transcriptional activator  39.73 
 
 		 77 aa  51.6  0.000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0964  putative bacteriophage transcriptional activator-related transcription regulator protein  42.86 
 
 		 73 aa  50.8  0.000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.809217  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2956  phage transcriptional activator, Ogr/delta  46.15 
 
 		 81 aa  50.4  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000761798 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0050  transcriptional activator Ogr/delta  38.81 
 
 		 80 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2617  transcriptional activator Ogr/delta  37.1 
 
 		 107 aa  48.5  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00204522  hitchhiker  0.000000000237412 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2583  transcriptional activator Ogr/delta  37.1 
 
 		 107 aa  48.5  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.000206926  hitchhiker  0.0000460899 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1628  transcriptional activator Ogr/delta  37.1 
 
 		 106 aa  47  0.00009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.350137  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1904  putative transcriptional activator transcription regulator protein  37.5 
 
 		 82 aa  44.7  0.0005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00444501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2888  transcriptional activator Ogr/delta  35.29 
 
 		 88 aa  44.3  0.0007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2666  transcriptional activator Ogr/delta  31.34 
 
 		 80 aa  42.4  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.058976  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>