33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_3104 on replicon NC_009436
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009436  Ent638_3104  phage transcriptional activator, Ogr/delta  100 
 
 
87 aa  181  2.0000000000000003e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.203632 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2956  phage transcriptional activator, Ogr/delta  65.43 
 
 
81 aa  115  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000761798 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0718  transcriptional activator Ogr/delta  70.83 
 
 
82 aa  100  5e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0050  transcriptional activator Ogr/delta  61.25 
 
 
80 aa  100  7e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3277  transcriptional activator Ogr/delta  66.67 
 
 
82 aa  94  6e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4151  putative transcriptional regulator  50.62 
 
 
81 aa  80.1  0.00000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.202641  normal  0.022006 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3199  transcriptional activator Ogr/delta  55.56 
 
 
72 aa  75.9  0.0000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.00001944  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3023  DNA-binding transcriptional regulator  50.77 
 
 
84 aa  74.7  0.0000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0341467 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3475  DNA-binding transcriptional regulator  61.54 
 
 
72 aa  74.7  0.0000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.100837  normal  0.103795 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4352  DNA-binding transcriptional regulator  50.77 
 
 
72 aa  74.3  0.0000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.481473 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0999  DNA-binding transcriptional regulator  50.77 
 
 
72 aa  74.3  0.0000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.603449  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1574  transcriptional activator Ogr/delta  57.41 
 
 
72 aa  73.6  0.000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0856  transcriptional activator Ogr/delta  52.38 
 
 
72 aa  72.8  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.0000000000414293  hitchhiker  0.000248698 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2106  transcriptional activator Ogr/delta  55.77 
 
 
64 aa  72.4  0.000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0144545  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1808  transcriptional activator Ogr/delta  55.77 
 
 
63 aa  70.9  0.000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.00000910407  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2306  transcriptional activator Ogr/delta  46.3 
 
 
71 aa  58.5  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.580847  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2353  transcriptional activator Ogr/delta  46.3 
 
 
71 aa  58.5  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000465197  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2194  phage transcriptional activator, Ogr/Delta  46.3 
 
 
71 aa  58.5  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1360  phage transcriptional activator, Ogr/delta  41.67 
 
 
71 aa  56.2  0.0000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00851  prophage P2 OGR-like protein  50.91 
 
 
83 aa  55.5  0.0000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00857  hypothetical protein  50.91 
 
 
83 aa  55.5  0.0000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2486  phage transcriptional activator, Ogr/Delta  50.91 
 
 
72 aa  55.5  0.0000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0949  phage transcriptional activator, Ogr/Delta  50.91 
 
 
72 aa  55.5  0.0000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.429231  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2750  transcriptional activator Ogr/delta  50.91 
 
 
72 aa  55.5  0.0000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00364612 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1060  transcriptional activator Ogr/delta  46.67 
 
 
166 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0384  putative activator encoded in prophage CP-933I  45.65 
 
 
73 aa  45.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.223602 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2195  Phage transcriptional activator, Ogr/Delta  37.1 
 
 
97 aa  44.3  0.0006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2666  transcriptional activator Ogr/delta  39.19 
 
 
80 aa  44.3  0.0006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.058976  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0964  putative bacteriophage transcriptional activator-related transcription regulator protein  36.25 
 
 
73 aa  43.5  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.809217  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1628  transcriptional activator Ogr/delta  37.88 
 
 
106 aa  40.8  0.006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.350137  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2617  transcriptional activator Ogr/delta  37.88 
 
 
107 aa  40.8  0.006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00204522  hitchhiker  0.000000000237412 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2583  transcriptional activator Ogr/delta  37.88 
 
 
107 aa  40.8  0.006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.000206926  hitchhiker  0.0000460899 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3117  transcriptional activator Ogr/delta  32.26 
 
 
88 aa  40.8  0.007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>