31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_3199 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_3199  transcriptional activator Ogr/delta  100 
 
 		 72 aa  155  2e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.00001944  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0856  transcriptional activator Ogr/delta  62.69 
 
 		 72 aa  102  2e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.0000000000414293  hitchhiker  0.000248698 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3475  DNA-binding transcriptional regulator  58.33 
 
 		 72 aa  100  5e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.100837  normal  0.103795 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3023  DNA-binding transcriptional regulator  59.72 
 
 		 84 aa  99.4  2e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0341467 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4352  DNA-binding transcriptional regulator  59.72 
 
 		 72 aa  99  2e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.481473 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0999  DNA-binding transcriptional regulator  59.72 
 
 		 72 aa  99  2e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.603449  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1574  transcriptional activator Ogr/delta  59.72 
 
 		 72 aa  98.6  3e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1808  transcriptional activator Ogr/delta  65.52 
 
 		 63 aa  88.2  3e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.00000910407  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2353  transcriptional activator Ogr/delta  53.52 
 
 		 71 aa  87.4  6e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000465197  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2106  transcriptional activator Ogr/delta  63.79 
 
 		 64 aa  87.4  6e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0144545  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2194  phage transcriptional activator, Ogr/Delta  52.11 
 
 		 71 aa  85.9  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2306  transcriptional activator Ogr/delta  52.11 
 
 		 71 aa  85.9  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.580847  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0949  phage transcriptional activator, Ogr/Delta  55.56 
 
 		 72 aa  82  0.000000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.429231  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00857  hypothetical protein  55.56 
 
 		 83 aa  82  0.000000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2750  transcriptional activator Ogr/delta  55.56 
 
 		 72 aa  82  0.000000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00364612 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00851  prophage P2 OGR-like protein  55.56 
 
 		 83 aa  82  0.000000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2486  phage transcriptional activator, Ogr/Delta  55.56 
 
 		 72 aa  82  0.000000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3104  phage transcriptional activator, Ogr/delta  55.56 
 
 		 87 aa  75.9  0.0000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.203632 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4151  putative transcriptional regulator  54.39 
 
 		 81 aa  75.1  0.0000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.202641  normal  0.022006 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0718  transcriptional activator Ogr/delta  50.85 
 
 		 82 aa  72  0.000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2956  phage transcriptional activator, Ogr/delta  51.67 
 
 		 81 aa  71.2  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000761798 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1360  phage transcriptional activator, Ogr/delta  49.21 
 
 		 71 aa  70.1  0.00000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3277  transcriptional activator Ogr/delta  50.85 
 
 		 82 aa  68.2  0.00000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0050  transcriptional activator Ogr/delta  49.15 
 
 		 80 aa  65.5  0.0000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0741  putative phage zinc-binding transcriptional activator  36.51 
 
 		 77 aa  47.8  0.00005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3117  transcriptional activator Ogr/delta  35.29 
 
 		 88 aa  44.7  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1060  transcriptional activator Ogr/delta  35.09 
 
 		 166 aa  43.5  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2195  Phage transcriptional activator, Ogr/Delta  39.58 
 
 		 97 aa  43.1  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2666  transcriptional activator Ogr/delta  36.21 
 
 		 80 aa  42.4  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.058976  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0964  putative bacteriophage transcriptional activator-related transcription regulator protein  35.29 
 
 		 73 aa  42.7  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.809217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2888  transcriptional activator Ogr/delta  39.22 
 
 		 88 aa  41.2  0.006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>