34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_2617 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_2617  transcriptional activator Ogr/delta  100 
 
 		 107 aa  222  1e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00204522  hitchhiker  0.000000000237412 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2583  transcriptional activator Ogr/delta  100 
 
 		 107 aa  222  1e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.000206926  hitchhiker  0.0000460899 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1628  transcriptional activator Ogr/delta  81.73 
 
 		 106 aa  179  8.000000000000001e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.350137  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1361  hypothetical protein  44.87 
 
 		 87 aa  68.2  0.00000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3117  transcriptional activator Ogr/delta  48.33 
 
 		 88 aa  66.2  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2195  Phage transcriptional activator, Ogr/Delta  45 
 
 		 97 aa  63.9  0.0000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1904  putative transcriptional activator transcription regulator protein  38.82 
 
 		 82 aa  62.4  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00444501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2888  transcriptional activator Ogr/delta  37.66 
 
 		 88 aa  60.8  0.000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0964  putative bacteriophage transcriptional activator-related transcription regulator protein  46.55 
 
 		 73 aa  59.7  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.809217  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4868  transcriptional activator Ogr/delta  40 
 
 		 82 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.547602  normal  0.181017 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0173  transcriptional activator Ogr/delta  38.46 
 
 		 82 aa  50.8  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1860  transcriptional activator Ogr/delta  33.72 
 
 		 91 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0672856  normal  0.0226752 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2666  transcriptional activator Ogr/delta  32.05 
 
 		 80 aa  49.3  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.058976  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4151  putative transcriptional regulator  35.06 
 
 		 81 aa  48.1  0.00004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.202641  normal  0.022006 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2306  transcriptional activator Ogr/delta  38.98 
 
 		 71 aa  47.8  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.580847  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2353  transcriptional activator Ogr/delta  37.1 
 
 		 71 aa  47.8  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000465197  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2194  phage transcriptional activator, Ogr/Delta  38.98 
 
 		 71 aa  47.8  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00857  hypothetical protein  35.94 
 
 		 83 aa  47  0.00009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00851  prophage P2 OGR-like protein  35.94 
 
 		 83 aa  47  0.00009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4132  hypothetical protein  35.71 
 
 		 87 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2486  phage transcriptional activator, Ogr/Delta  35.94 
 
 		 72 aa  46.6  0.0001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2750  transcriptional activator Ogr/delta  35.94 
 
 		 72 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00364612 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0949  phage transcriptional activator, Ogr/Delta  35.94 
 
 		 72 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.429231  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3704  transcriptional activator Ogr/delta  35.71 
 
 		 87 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.04056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1733  phage transcriptional activator, Ogr/delta  35.71 
 
 		 87 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.000208403  normal  0.718201 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0741  putative phage zinc-binding transcriptional activator  38.98 
 
 		 77 aa  45.8  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1360  phage transcriptional activator, Ogr/delta  50 
 
 		 71 aa  45.8  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0718  transcriptional activator Ogr/delta  34.29 
 
 		 82 aa  45.1  0.0003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0237  transcriptional activator Ogr/delta  41.38 
 
 		 80 aa  44.7  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000439463  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3277  transcriptional activator Ogr/delta  34.29 
 
 		 82 aa  44.3  0.0006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3319  phage transcriptional activator, Ogr/delta  30 
 
 		 141 aa  43.1  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.359919  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1808  transcriptional activator Ogr/delta  39.58 
 
 		 63 aa  42  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.00000910407  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2106  transcriptional activator Ogr/delta  37.5 
 
 		 64 aa  41.6  0.004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0144545  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3104  phage transcriptional activator, Ogr/delta  32.86 
 
 		 87 aa  40.8  0.007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.203632 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>