36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_A4151 on replicon NC_010159
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010159  YpAngola_A4151  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 81 aa  167  3e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.202641  normal  0.022006 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3104  phage transcriptional activator, Ogr/delta  50.62 
 
 		 87 aa  80.1  0.00000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.203632 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2956  phage transcriptional activator, Ogr/delta  48.75 
 
 		 81 aa  78.2  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000761798 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0856  transcriptional activator Ogr/delta  54.41 
 
 		 72 aa  77.8  0.00000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.0000000000414293  hitchhiker  0.000248698 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3199  transcriptional activator Ogr/delta  54.39 
 
 		 72 aa  75.1  0.0000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.00001944  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2106  transcriptional activator Ogr/delta  55.74 
 
 		 64 aa  75.1  0.0000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0144545  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0050  transcriptional activator Ogr/delta  51.95 
 
 		 80 aa  74.3  0.0000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3475  DNA-binding transcriptional regulator  61.54 
 
 		 72 aa  73.6  0.000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.100837  normal  0.103795 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0718  transcriptional activator Ogr/delta  49.23 
 
 		 82 aa  70.9  0.000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1574  transcriptional activator Ogr/delta  53.85 
 
 		 72 aa  69.7  0.00000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1808  transcriptional activator Ogr/delta  50.88 
 
 		 63 aa  70.1  0.00000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.00000910407  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3023  DNA-binding transcriptional regulator  53.85 
 
 		 84 aa  69.7  0.00000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0341467 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0999  DNA-binding transcriptional regulator  53.85 
 
 		 72 aa  69.7  0.00000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.603449  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4352  DNA-binding transcriptional regulator  53.85 
 
 		 72 aa  69.7  0.00000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.481473 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3277  transcriptional activator Ogr/delta  46.15 
 
 		 82 aa  66.6  0.0000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0384  putative activator encoded in prophage CP-933I  46.55 
 
 		 73 aa  58.5  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.223602 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2306  transcriptional activator Ogr/delta  44.23 
 
 		 71 aa  56.6  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.580847  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2353  transcriptional activator Ogr/delta  44.23 
 
 		 71 aa  56.2  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000465197  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2194  phage transcriptional activator, Ogr/Delta  44.23 
 
 		 71 aa  56.6  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00851  prophage P2 OGR-like protein  49.12 
 
 		 83 aa  55.5  0.0000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00857  hypothetical protein  49.12 
 
 		 83 aa  55.5  0.0000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1360  phage transcriptional activator, Ogr/delta  50 
 
 		 71 aa  55.8  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0949  phage transcriptional activator, Ogr/Delta  49.12 
 
 		 72 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.429231  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2486  phage transcriptional activator, Ogr/Delta  49.12 
 
 		 72 aa  55.1  0.0000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2750  transcriptional activator Ogr/delta  49.12 
 
 		 72 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00364612 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2583  transcriptional activator Ogr/delta  35.06 
 
 		 107 aa  48.1  0.00004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.000206926  hitchhiker  0.0000460899 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2617  transcriptional activator Ogr/delta  35.06 
 
 		 107 aa  48.1  0.00004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00204522  hitchhiker  0.000000000237412 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1628  transcriptional activator Ogr/delta  33.77 
 
 		 106 aa  47  0.00008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.350137  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1060  transcriptional activator Ogr/delta  44.44 
 
 		 166 aa  47  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2195  Phage transcriptional activator, Ogr/Delta  31.25 
 
 		 97 aa  46.6  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2666  transcriptional activator Ogr/delta  30.77 
 
 		 80 aa  43.5  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.058976  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3117  transcriptional activator Ogr/delta  32.76 
 
 		 88 aa  42.7  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0964  putative bacteriophage transcriptional activator-related transcription regulator protein  36.21 
 
 		 73 aa  42.7  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.809217  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0173  transcriptional activator Ogr/delta  37.18 
 
 		 82 aa  40.4  0.008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4868  transcriptional activator Ogr/delta  38.89 
 
 		 82 aa  40.4  0.008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.547602  normal  0.181017 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1904  putative transcriptional activator transcription regulator protein  35.38 
 
 		 82 aa  40.4  0.009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00444501  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>