22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcolC_1060 on replicon NC_010468
Organism: Escherichia coli ATCC 8739



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010468  EcolC_1060  transcriptional activator Ogr/delta  100 
 
 		 166 aa  345  2e-94  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0718  transcriptional activator Ogr/delta  48.89 
 
 		 82 aa  51.6  0.000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3277  transcriptional activator Ogr/delta  51.11 
 
 		 82 aa  50.1  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3475  DNA-binding transcriptional regulator  42.86 
 
 		 72 aa  50.1  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.100837  normal  0.103795 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0856  transcriptional activator Ogr/delta  48.89 
 
 		 72 aa  50.1  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.0000000000414293  hitchhiker  0.000248698 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0050  transcriptional activator Ogr/delta  52.38 
 
 		 80 aa  49.7  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2956  phage transcriptional activator, Ogr/delta  45.65 
 
 		 81 aa  48.5  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000761798 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2106  transcriptional activator Ogr/delta  38.6 
 
 		 64 aa  47.8  0.00006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0144545  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1574  transcriptional activator Ogr/delta  47.73 
 
 		 72 aa  47  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3023  DNA-binding transcriptional regulator  47.73 
 
 		 84 aa  47  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0341467 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4352  DNA-binding transcriptional regulator  47.73 
 
 		 72 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.481473 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4151  putative transcriptional regulator  44.44 
 
 		 81 aa  47  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.202641  normal  0.022006 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0999  DNA-binding transcriptional regulator  47.73 
 
 		 72 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.603449  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3104  phage transcriptional activator, Ogr/delta  46.67 
 
 		 87 aa  46.6  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.203632 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1808  transcriptional activator Ogr/delta  40.82 
 
 		 63 aa  44.3  0.0009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.00000910407  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00857  hypothetical protein  46.67 
 
 		 83 aa  43.5  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3199  transcriptional activator Ogr/delta  35.09 
 
 		 72 aa  43.5  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.00001944  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00851  prophage P2 OGR-like protein  46.67 
 
 		 83 aa  43.5  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2750  transcriptional activator Ogr/delta  46.67 
 
 		 72 aa  43.1  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00364612 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2486  phage transcriptional activator, Ogr/Delta  46.67 
 
 		 72 aa  43.1  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0949  phage transcriptional activator, Ogr/Delta  46.67 
 
 		 72 aa  43.1  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.429231  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1360  phage transcriptional activator, Ogr/delta  44.44 
 
 		 71 aa  41.2  0.006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>