40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A1950 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007347  Reut_A1950  hypothetical protein  100 
 
 
163 aa  325  2.0000000000000001e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2463  hypothetical protein  78.05 
 
 
133 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0823141  normal  0.51685 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1779  hypothetical protein  75 
 
 
133 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0430501  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4776  hypothetical protein  48.21 
 
 
218 aa  130  6e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2725  hypothetical protein  46.01 
 
 
127 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.10817  normal  0.379406 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3651  hypothetical protein  54.14 
 
 
135 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.559978  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3165  hypothetical protein  53.12 
 
 
130 aa  121  4e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.838623  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1762  hypothetical protein  50.78 
 
 
124 aa  120  6e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0701529  normal  0.0375029 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2769  hypothetical protein  53.12 
 
 
127 aa  118  3e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.178308 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0933  hypothetical protein  44.85 
 
 
137 aa  118  3e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.823295  normal  0.972852 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2129  hypothetical protein  46.3 
 
 
148 aa  118  3e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.388203  normal  0.874817 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1806  hypothetical protein  58.88 
 
 
124 aa  117  4.9999999999999996e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6022  hypothetical protein  45.12 
 
 
136 aa  117  7e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0878521  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0325  hypothetical protein  64.63 
 
 
130 aa  117  9e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0691109  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4267  hypothetical protein  42.33 
 
 
145 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.831711  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0299  hypothetical protein  64.63 
 
 
130 aa  115  1.9999999999999998e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000865881  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4369  hypothetical protein  51.69 
 
 
142 aa  114  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4845  hypothetical protein  51.69 
 
 
142 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2770  hypothetical protein  64.63 
 
 
127 aa  114  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.978745 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4170  hypothetical protein  66.23 
 
 
135 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1755  hypothetical protein  59.52 
 
 
149 aa  111  4.0000000000000004e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7475  hypothetical protein  44.1 
 
 
157 aa  110  7.000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.579017  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5538  hypothetical protein  63.41 
 
 
135 aa  110  8.000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0167677 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5801  hypothetical protein  60 
 
 
138 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0109079 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1558  hypothetical protein  55.81 
 
 
146 aa  107  6e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.908267  normal  0.651705 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4393  hypothetical protein  71.64 
 
 
135 aa  104  5e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0455324 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0169  hypothetical protein  44.1 
 
 
198 aa  101  4e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1843  hypothetical protein  56.98 
 
 
147 aa  99.8  1e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.254638 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0082  hypothetical protein  40.24 
 
 
209 aa  92.8  2e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2386  hypothetical protein  52.27 
 
 
173 aa  90.5  9e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0070  hypothetical protein  50 
 
 
134 aa  88.2  4e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2129  hypothetical protein  60.98 
 
 
129 aa  87  9e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4189  hypothetical protein  51.14 
 
 
140 aa  85.1  4e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.219092 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1853  hypothetical protein  50 
 
 
169 aa  83.6  0.000000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0175137 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5074  hypothetical protein  55.42 
 
 
125 aa  82.4  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.899255  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1883  hypothetical protein  62.5 
 
 
58 aa  77  0.0000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18200  hypothetical protein  49.4 
 
 
85 aa  61.6  0.000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0055  hypothetical protein  53.7 
 
 
78 aa  58.5  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5347  hypothetical protein  44.83 
 
 
140 aa  43.9  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.975966 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0657  preprotein translocase, SecA subunit  35.37 
 
 
1024 aa  40.4  0.01  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0383257  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>