40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_5347 on replicon NC_009507
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009507  Swit_5347  hypothetical protein  100 
 
 		 140 aa  273  6e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.975966 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4776  hypothetical protein  48.48 
 
 		 218 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0169  hypothetical protein  43.59 
 
 		 198 aa  113  7.999999999999999e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0933  hypothetical protein  46.43 
 
 		 137 aa  112  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.823295  normal  0.972852 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2725  hypothetical protein  47.86 
 
 		 127 aa  110  5e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.10817  normal  0.379406 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7475  hypothetical protein  44.65 
 
 		 157 aa  106  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.579017  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6022  hypothetical protein  47.89 
 
 		 136 aa  105  2e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0878521  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4267  hypothetical protein  43.15 
 
 		 145 aa  103  5e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.831711  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2769  hypothetical protein  47.52 
 
 		 127 aa  103  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.178308 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3165  hypothetical protein  47.52 
 
 		 130 aa  102  1e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.838623  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5801  hypothetical protein  44.29 
 
 		 138 aa  100  9e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0109079 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4369  hypothetical protein  44.44 
 
 		 142 aa  98.2  3e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4845  hypothetical protein  44.44 
 
 		 142 aa  97.1  7e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5538  hypothetical protein  53.52 
 
 		 135 aa  96.7  9e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0167677 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2129  hypothetical protein  44.3 
 
 		 148 aa  96.7  9e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.388203  normal  0.874817 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3651  hypothetical protein  44.68 
 
 		 135 aa  93.6  7e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.559978  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5074  hypothetical protein  47.14 
 
 		 125 aa  93.6  7e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.899255  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0082  hypothetical protein  50.71 
 
 		 209 aa  93.6  9e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2770  hypothetical protein  42.86 
 
 		 127 aa  92.8  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.978745 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1762  hypothetical protein  43.26 
 
 		 124 aa  92.4  2e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0701529  normal  0.0375029 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1843  hypothetical protein  45.89 
 
 		 147 aa  90.1  1e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.254638 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1755  hypothetical protein  47.37 
 
 		 149 aa  88.2  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0070  hypothetical protein  50.71 
 
 		 134 aa  87  7e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1806  hypothetical protein  40.71 
 
 		 124 aa  87  8e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2386  hypothetical protein  44.6 
 
 		 173 aa  86.7  1e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1779  hypothetical protein  42.86 
 
 		 133 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0430501  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1853  hypothetical protein  43.17 
 
 		 169 aa  81.3  0.000000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0175137 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0299  hypothetical protein  44.2 
 
 		 130 aa  80.5  0.000000000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000865881  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1950  hypothetical protein  35.37 
 
 		 163 aa  79.7  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1558  hypothetical protein  45.45 
 
 		 146 aa  79.3  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.908267  normal  0.651705 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4189  hypothetical protein  44.6 
 
 		 140 aa  79  0.00000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.219092 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0325  hypothetical protein  43.48 
 
 		 130 aa  77.8  0.00000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0691109  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2463  hypothetical protein  43.48 
 
 		 133 aa  77.8  0.00000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0823141  normal  0.51685 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4393  hypothetical protein  47.14 
 
 		 135 aa  77  0.00000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0455324 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4170  hypothetical protein  57.38 
 
 		 135 aa  72.4  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2129  hypothetical protein  46.76 
 
 		 129 aa  71.2  0.000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1883  hypothetical protein  60 
 
 		 58 aa  67.4  0.00000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08115  conserved hypothetical protein  38.68 
 
 		 419 aa  55.8  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0160028  normal  0.190332 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18200  hypothetical protein  58.33 
 
 		 85 aa  55.1  0.0000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0055  hypothetical protein  54.9 
 
 		 78 aa  49.7  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>