40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_4189 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_4189  hypothetical protein  100 
 
 		 140 aa  273  5e-73  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.219092 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1853  hypothetical protein  74.1 
 
 		 169 aa  187  2.9999999999999997e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0175137 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2386  hypothetical protein  71.43 
 
 		 173 aa  174  3e-43  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0070  hypothetical protein  67.86 
 
 		 134 aa  170  6.999999999999999e-42  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0082  hypothetical protein  65.71 
 
 		 209 aa  164  2.9999999999999998e-40  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18200  hypothetical protein  78.57 
 
 		 85 aa  114  5e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2129  hypothetical protein  49.01 
 
 		 148 aa  110  7.000000000000001e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.388203  normal  0.874817 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3165  hypothetical protein  46.04 
 
 		 130 aa  104  4e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.838623  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5538  hypothetical protein  65.06 
 
 		 135 aa  104  5e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0167677 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1558  hypothetical protein  54.26 
 
 		 146 aa  103  7e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.908267  normal  0.651705 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2725  hypothetical protein  47.14 
 
 		 127 aa  103  1e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.10817  normal  0.379406 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0933  hypothetical protein  45.59 
 
 		 137 aa  102  2e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.823295  normal  0.972852 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4267  hypothetical protein  43.92 
 
 		 145 aa  101  4e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.831711  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4845  hypothetical protein  44.76 
 
 		 142 aa  100  5e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4776  hypothetical protein  43.75 
 
 		 218 aa  99.4  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1755  hypothetical protein  52.63 
 
 		 149 aa  99.8  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4369  hypothetical protein  46.43 
 
 		 142 aa  98.6  2e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6022  hypothetical protein  46.48 
 
 		 136 aa  99  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0878521  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7475  hypothetical protein  44.23 
 
 		 157 aa  99  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.579017  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3651  hypothetical protein  45.52 
 
 		 135 aa  97.1  8e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.559978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0299  hypothetical protein  49.28 
 
 		 130 aa  97.1  8e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000865881  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4170  hypothetical protein  62.34 
 
 		 135 aa  94.7  3e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0169  hypothetical protein  42.21 
 
 		 198 aa  94  6e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0325  hypothetical protein  48.55 
 
 		 130 aa  94  7e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0691109  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2769  hypothetical protein  43.88 
 
 		 127 aa  93.6  8e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.178308 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0055  hypothetical protein  75.93 
 
 		 78 aa  91.7  3e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5801  hypothetical protein  42.25 
 
 		 138 aa  90.9  5e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0109079 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2770  hypothetical protein  44.2 
 
 		 127 aa  88.6  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.978745 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1950  hypothetical protein  46.43 
 
 		 163 aa  87.4  6e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1762  hypothetical protein  41.73 
 
 		 124 aa  87  8e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0701529  normal  0.0375029 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1843  hypothetical protein  45.95 
 
 		 147 aa  85.5  2e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.254638 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1806  hypothetical protein  39.13 
 
 		 124 aa  85.9  2e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4393  hypothetical protein  58.82 
 
 		 135 aa  80.9  0.000000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0455324 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2463  hypothetical protein  49.4 
 
 		 133 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0823141  normal  0.51685 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5074  hypothetical protein  55.95 
 
 		 125 aa  79.7  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.899255  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1779  hypothetical protein  48.19 
 
 		 133 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0430501  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2129  hypothetical protein  45.65 
 
 		 129 aa  69.3  0.00000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1883  hypothetical protein  58.93 
 
 		 58 aa  63.5  0.0000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5347  hypothetical protein  43.97 
 
 		 140 aa  52.8  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.975966 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08115  conserved hypothetical protein  37.23 
 
 		 419 aa  43.1  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0160028  normal  0.190332 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>