39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BRA0325 on replicon NC_004311
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004311  BRA0325  hypothetical protein  100 
 
 
130 aa  259  8.999999999999999e-69  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0691109  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0299  hypothetical protein  98.46 
 
 
130 aa  254  3e-67  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000865881  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4170  hypothetical protein  77.04 
 
 
135 aa  156  9e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1755  hypothetical protein  53.95 
 
 
149 aa  146  9e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3165  hypothetical protein  58.59 
 
 
130 aa  140  7e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.838623  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1558  hypothetical protein  54.17 
 
 
146 aa  137  4.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.908267  normal  0.651705 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6022  hypothetical protein  59.32 
 
 
136 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0878521  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2725  hypothetical protein  56.06 
 
 
127 aa  130  6.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.10817  normal  0.379406 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1950  hypothetical protein  56.03 
 
 
163 aa  125  2.0000000000000002e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2769  hypothetical protein  53.08 
 
 
127 aa  124  3e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.178308 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2770  hypothetical protein  56.15 
 
 
127 aa  124  4.0000000000000003e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.978745 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1762  hypothetical protein  56.25 
 
 
124 aa  123  9e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0701529  normal  0.0375029 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5801  hypothetical protein  54.62 
 
 
138 aa  122  2e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0109079 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4267  hypothetical protein  51.16 
 
 
145 aa  120  9e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.831711  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7475  hypothetical protein  60.19 
 
 
157 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.579017  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4776  hypothetical protein  43.87 
 
 
218 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1779  hypothetical protein  52.67 
 
 
133 aa  118  3e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0430501  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2463  hypothetical protein  53.44 
 
 
133 aa  118  3e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0823141  normal  0.51685 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1806  hypothetical protein  53.12 
 
 
124 aa  117  7e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4369  hypothetical protein  47.1 
 
 
142 aa  115  9.999999999999999e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4845  hypothetical protein  47.83 
 
 
142 aa  116  9.999999999999999e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0933  hypothetical protein  57.69 
 
 
137 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.823295  normal  0.972852 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2129  hypothetical protein  50 
 
 
148 aa  115  1.9999999999999998e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.388203  normal  0.874817 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3651  hypothetical protein  47.48 
 
 
135 aa  115  3e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.559978  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0169  hypothetical protein  45.75 
 
 
198 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5538  hypothetical protein  62.2 
 
 
135 aa  104  4e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0167677 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1843  hypothetical protein  63.41 
 
 
147 aa  103  8e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.254638 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4393  hypothetical protein  51.54 
 
 
135 aa  100  6e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0455324 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0082  hypothetical protein  47.41 
 
 
209 aa  93.6  8e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0070  hypothetical protein  46.62 
 
 
134 aa  91.7  3e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2386  hypothetical protein  49.63 
 
 
173 aa  91.3  4e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1853  hypothetical protein  54.17 
 
 
169 aa  90.1  9e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0175137 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4189  hypothetical protein  56.63 
 
 
140 aa  86.3  1e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.219092 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1883  hypothetical protein  69.09 
 
 
58 aa  79.3  0.00000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5074  hypothetical protein  54.32 
 
 
125 aa  77  0.00000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.899255  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2129  hypothetical protein  43.85 
 
 
129 aa  75.9  0.0000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18200  hypothetical protein  53.01 
 
 
85 aa  64.7  0.0000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0055  hypothetical protein  57.69 
 
 
78 aa  60.8  0.000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5347  hypothetical protein  51.85 
 
 
140 aa  52  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.975966 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>