39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_0169 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_0169  hypothetical protein  100 
 
 
198 aa  396  9.999999999999999e-111  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7475  hypothetical protein  73.25 
 
 
157 aa  199  3e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.579017  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0933  hypothetical protein  57.59 
 
 
137 aa  160  1e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.823295  normal  0.972852 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6022  hypothetical protein  56.05 
 
 
136 aa  149  3e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0878521  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4267  hypothetical protein  56.05 
 
 
145 aa  148  6e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.831711  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4369  hypothetical protein  56.49 
 
 
142 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4845  hypothetical protein  57.14 
 
 
142 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4776  hypothetical protein  49.72 
 
 
218 aa  144  6e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2129  hypothetical protein  54.43 
 
 
148 aa  143  2e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.388203  normal  0.874817 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5801  hypothetical protein  55.41 
 
 
138 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0109079 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2725  hypothetical protein  51.61 
 
 
127 aa  134  8e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.10817  normal  0.379406 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3165  hypothetical protein  50.32 
 
 
130 aa  134  8e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.838623  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1843  hypothetical protein  49.68 
 
 
147 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.254638 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3651  hypothetical protein  47.4 
 
 
135 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.559978  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1755  hypothetical protein  47.06 
 
 
149 aa  123  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2769  hypothetical protein  47.74 
 
 
127 aa  123  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.178308 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2770  hypothetical protein  46.45 
 
 
127 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.978745 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5538  hypothetical protein  67.86 
 
 
135 aa  117  9e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0167677 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1762  hypothetical protein  43.23 
 
 
124 aa  116  1.9999999999999998e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0701529  normal  0.0375029 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1883  hypothetical protein  91.38 
 
 
58 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0325  hypothetical protein  46 
 
 
130 aa  108  6e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0691109  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0299  hypothetical protein  46 
 
 
130 aa  108  8.000000000000001e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000865881  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1806  hypothetical protein  43.87 
 
 
124 aa  107  1e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4170  hypothetical protein  70.27 
 
 
135 aa  105  5e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2463  hypothetical protein  44.44 
 
 
133 aa  104  9e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0823141  normal  0.51685 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2129  hypothetical protein  49.36 
 
 
129 aa  104  9e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1558  hypothetical protein  45.1 
 
 
146 aa  103  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.908267  normal  0.651705 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1950  hypothetical protein  44.1 
 
 
163 aa  103  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1779  hypothetical protein  42.48 
 
 
133 aa  102  3e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0430501  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4393  hypothetical protein  66.67 
 
 
135 aa  99.8  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0455324 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2386  hypothetical protein  44.52 
 
 
173 aa  95.1  6e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0082  hypothetical protein  39.02 
 
 
209 aa  94.7  8e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1853  hypothetical protein  57.83 
 
 
169 aa  90.5  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0175137 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0070  hypothetical protein  56.63 
 
 
134 aa  86.3  3e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4189  hypothetical protein  56.63 
 
 
140 aa  83.2  0.000000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.219092 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5074  hypothetical protein  37.01 
 
 
125 aa  77.4  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.899255  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18200  hypothetical protein  60 
 
 
85 aa  73.2  0.000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5347  hypothetical protein  56.82 
 
 
140 aa  65.9  0.0000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.975966 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0055  hypothetical protein  58.82 
 
 
78 aa  60.5  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>