39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_1853 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_1853  hypothetical protein  100 
 
 		 169 aa  343  5e-94  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0175137 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2386  hypothetical protein  65.52 
 
 		 173 aa  173  9.999999999999999e-43  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4189  hypothetical protein  69.06 
 
 		 140 aa  172  1.9999999999999998e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.219092 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0082  hypothetical protein  62.5 
 
 		 209 aa  170  1e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0070  hypothetical protein  67.15 
 
 		 134 aa  164  5e-40  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18200  hypothetical protein  79.76 
 
 		 85 aa  118  4.9999999999999996e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5538  hypothetical protein  65.06 
 
 		 135 aa  107  1e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0167677 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3165  hypothetical protein  45.19 
 
 		 130 aa  103  1e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.838623  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0933  hypothetical protein  48.53 
 
 		 137 aa  101  5e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.823295  normal  0.972852 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4776  hypothetical protein  61.45 
 
 		 218 aa  99.8  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3651  hypothetical protein  45.93 
 
 		 135 aa  99.4  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.559978  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1558  hypothetical protein  52.63 
 
 		 146 aa  99.8  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.908267  normal  0.651705 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2129  hypothetical protein  60.24 
 
 		 148 aa  99.4  2e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.388203  normal  0.874817 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2725  hypothetical protein  45.45 
 
 		 127 aa  99.4  2e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.10817  normal  0.379406 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4845  hypothetical protein  50.98 
 
 		 142 aa  98.6  4e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4369  hypothetical protein  50 
 
 		 142 aa  97.4  8e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7475  hypothetical protein  52.83 
 
 		 157 aa  97.4  9e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.579017  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1755  hypothetical protein  49.46 
 
 		 149 aa  96.3  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6022  hypothetical protein  44.62 
 
 		 136 aa  96.3  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0878521  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4267  hypothetical protein  57.83 
 
 		 145 aa  95.1  4e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.831711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4170  hypothetical protein  61.04 
 
 		 135 aa  94.7  6e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0299  hypothetical protein  57.83 
 
 		 130 aa  92.8  2e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000865881  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0169  hypothetical protein  52.58 
 
 		 198 aa  92  3e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2770  hypothetical protein  54.12 
 
 		 127 aa  92  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.978745 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5801  hypothetical protein  50.53 
 
 		 138 aa  91.7  4e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0109079 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2769  hypothetical protein  43.18 
 
 		 127 aa  90.9  7e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.178308 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0055  hypothetical protein  81.13 
 
 		 78 aa  90.9  7e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0325  hypothetical protein  56.63 
 
 		 130 aa  89.7  2e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0691109  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1843  hypothetical protein  41.45 
 
 		 147 aa  89  3e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.254638 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1762  hypothetical protein  45.74 
 
 		 124 aa  88.6  4e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0701529  normal  0.0375029 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1806  hypothetical protein  50.59 
 
 		 124 aa  87.4  9e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4393  hypothetical protein  61.76 
 
 		 135 aa  85.5  3e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0455324 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1779  hypothetical protein  41.91 
 
 		 133 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0430501  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1950  hypothetical protein  50 
 
 		 163 aa  83.6  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2463  hypothetical protein  50.6 
 
 		 133 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0823141  normal  0.51685 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5074  hypothetical protein  57.32 
 
 		 125 aa  81.3  0.000000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.899255  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2129  hypothetical protein  59.04 
 
 		 129 aa  69.7  0.00000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1883  hypothetical protein  60.71 
 
 		 58 aa  67  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5347  hypothetical protein  53.49 
 
 		 140 aa  56.6  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.975966 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>