40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_2769 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_2769  hypothetical protein  100 
 
 		 127 aa  254  3e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.178308 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3165  hypothetical protein  74.62 
 
 		 130 aa  183  7e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.838623  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2725  hypothetical protein  73.23 
 
 		 127 aa  181  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.10817  normal  0.379406 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1762  hypothetical protein  67.97 
 
 		 124 aa  168  2e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0701529  normal  0.0375029 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2770  hypothetical protein  71.65 
 
 		 127 aa  168  3e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.978745 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1806  hypothetical protein  70.87 
 
 		 124 aa  166  1e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4393  hypothetical protein  68.15 
 
 		 135 aa  146  8e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0455324 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3651  hypothetical protein  53.28 
 
 		 135 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.559978  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4776  hypothetical protein  48.75 
 
 		 218 aa  127  6e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2129  hypothetical protein  48.99 
 
 		 148 aa  127  7.000000000000001e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.388203  normal  0.874817 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4845  hypothetical protein  48.61 
 
 		 142 aa  123  9e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4267  hypothetical protein  47.92 
 
 		 145 aa  123  9e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.831711  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0933  hypothetical protein  49.64 
 
 		 137 aa  123  1e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.823295  normal  0.972852 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1755  hypothetical protein  46.98 
 
 		 149 aa  122  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1843  hypothetical protein  51.02 
 
 		 147 aa  122  2e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.254638 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7475  hypothetical protein  43.31 
 
 		 157 aa  121  3e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.579017  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4369  hypothetical protein  47.22 
 
 		 142 aa  120  5e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6022  hypothetical protein  50.36 
 
 		 136 aa  117  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0878521  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1779  hypothetical protein  51.15 
 
 		 133 aa  116  9e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0430501  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0325  hypothetical protein  52.71 
 
 		 130 aa  116  9.999999999999999e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0691109  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2463  hypothetical protein  51.15 
 
 		 133 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0823141  normal  0.51685 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0299  hypothetical protein  52.71 
 
 		 130 aa  116  9.999999999999999e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000865881  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1950  hypothetical protein  54.39 
 
 		 163 aa  115  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5538  hypothetical protein  51.47 
 
 		 135 aa  114  5e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0167677 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0169  hypothetical protein  43.87 
 
 		 198 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2129  hypothetical protein  56.69 
 
 		 129 aa  111  3e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1558  hypothetical protein  44.22 
 
 		 146 aa  110  4.0000000000000004e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.908267  normal  0.651705 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4170  hypothetical protein  69.33 
 
 		 135 aa  108  2.0000000000000002e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5801  hypothetical protein  45.26 
 
 		 138 aa  105  3e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0109079 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0082  hypothetical protein  43.17 
 
 		 209 aa  93.6  8e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0070  hypothetical protein  46.21 
 
 		 134 aa  92.4  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2386  hypothetical protein  60.53 
 
 		 173 aa  87.8  4e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1853  hypothetical protein  57.89 
 
 		 169 aa  86.7  9e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0175137 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5074  hypothetical protein  45.24 
 
 		 125 aa  84.3  5e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.899255  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1883  hypothetical protein  63.16 
 
 		 58 aa  82.4  0.000000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4189  hypothetical protein  55.26 
 
 		 140 aa  80.5  0.000000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.219092 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18200  hypothetical protein  56.96 
 
 		 85 aa  69.7  0.00000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0055  hypothetical protein  60.78 
 
 		 78 aa  64.7  0.0000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5347  hypothetical protein  52.87 
 
 		 140 aa  60.5  0.000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.975966 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08115  conserved hypothetical protein  31.13 
 
 		 419 aa  48.5  0.00003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0160028  normal  0.190332 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>