40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_5074 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_5074  hypothetical protein  100 
 
 		 125 aa  243  6e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.899255  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3651  hypothetical protein  51.88 
 
 		 135 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.559978  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3165  hypothetical protein  53.08 
 
 		 130 aa  106  1e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.838623  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4776  hypothetical protein  43.83 
 
 		 218 aa  105  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5538  hypothetical protein  53.33 
 
 		 135 aa  105  3e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0167677 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2725  hypothetical protein  48.89 
 
 		 127 aa  104  5e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.10817  normal  0.379406 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2769  hypothetical protein  48.84 
 
 		 127 aa  104  5e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.178308 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6022  hypothetical protein  45.65 
 
 		 136 aa  103  7e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0878521  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2770  hypothetical protein  47.62 
 
 		 127 aa  101  4e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.978745 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0933  hypothetical protein  45.59 
 
 		 137 aa  98.6  3e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.823295  normal  0.972852 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4267  hypothetical protein  39.31 
 
 		 145 aa  97.1  8e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.831711  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4845  hypothetical protein  42.96 
 
 		 142 aa  96.3  1e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1762  hypothetical protein  47.24 
 
 		 124 aa  95.1  3e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0701529  normal  0.0375029 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2129  hypothetical protein  43.33 
 
 		 148 aa  94.4  5e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.388203  normal  0.874817 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4369  hypothetical protein  41.55 
 
 		 142 aa  94.4  5e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5801  hypothetical protein  42.75 
 
 		 138 aa  94.4  5e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0109079 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1779  hypothetical protein  50.38 
 
 		 133 aa  94  6e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0430501  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7475  hypothetical protein  42.58 
 
 		 157 aa  92.8  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.579017  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2463  hypothetical protein  51.15 
 
 		 133 aa  92  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0823141  normal  0.51685 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1806  hypothetical protein  47.24 
 
 		 124 aa  91.7  3e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0299  hypothetical protein  48.46 
 
 		 130 aa  90.9  5e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000865881  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1950  hypothetical protein  49.15 
 
 		 163 aa  90.5  8e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0325  hypothetical protein  47.69 
 
 		 130 aa  87.8  5e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0691109  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1843  hypothetical protein  41.89 
 
 		 147 aa  87.4  5e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.254638 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0169  hypothetical protein  39.35 
 
 		 198 aa  87.8  5e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1853  hypothetical protein  47.62 
 
 		 169 aa  87.8  5e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0175137 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4393  hypothetical protein  63.64 
 
 		 135 aa  86.3  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0455324 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1755  hypothetical protein  38.93 
 
 		 149 aa  85.9  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0070  hypothetical protein  45.59 
 
 		 134 aa  85.5  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1558  hypothetical protein  43.15 
 
 		 146 aa  84.7  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.908267  normal  0.651705 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2386  hypothetical protein  46.32 
 
 		 173 aa  82.4  0.000000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0082  hypothetical protein  43.8 
 
 		 209 aa  82.4  0.000000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4189  hypothetical protein  55.95 
 
 		 140 aa  80.1  0.000000000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.219092 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4170  hypothetical protein  53.25 
 
 		 135 aa  78.6  0.00000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2129  hypothetical protein  49.61 
 
 		 129 aa  76.6  0.0000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5347  hypothetical protein  45 
 
 		 140 aa  69.7  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.975966 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1883  hypothetical protein  49.09 
 
 		 58 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0055  hypothetical protein  53.7 
 
 		 78 aa  53.1  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18200  hypothetical protein  59.09 
 
 		 85 aa  49.3  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08115  conserved hypothetical protein  32.74 
 
 		 419 aa  46.6  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0160028  normal  0.190332 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>