15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_2275 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_2275  hypothetical protein  100 
 
 
229 aa  451  1.0000000000000001e-126  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00081012  unclonable  0.000000000430819 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1515  hypothetical protein  82.17 
 
 
199 aa  216  2.9999999999999998e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.120523  normal  0.0475034 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1060  hypothetical protein  44.98 
 
 
213 aa  155  5.0000000000000005e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1271  hypothetical protein  29.27 
 
 
240 aa  80.1  0.00000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3315  hypothetical protein  38.39 
 
 
158 aa  79.7  0.00000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.535647 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2271  FHA domain-containing protein  33.76 
 
 
231 aa  76.3  0.0000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0933302  hitchhiker  0.000000132679 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0053  hypothetical protein  36 
 
 
161 aa  72.8  0.000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.275779  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1621  FHA domain-containing protein  31.03 
 
 
230 aa  67.4  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.437766  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1006  hypothetical protein  37.33 
 
 
90 aa  58.5  0.00000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2117  hypothetical protein  32.88 
 
 
132 aa  48.5  0.00009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2164  hypothetical protein  32.88 
 
 
132 aa  48.5  0.00009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.473098  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3357  hypothetical protein  34.72 
 
 
205 aa  47.4  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.000177334  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1663  hypothetical protein  32.11 
 
 
2449 aa  47.8  0.0002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3295  hypothetical protein  37.7 
 
 
88 aa  45.1  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0376  hypothetical protein  30.99 
 
 
147 aa  42  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>