15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0053 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_0053  hypothetical protein  100 
 
 		 161 aa  323  4.0000000000000003e-88  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.275779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3315  hypothetical protein  74.38 
 
 		 158 aa  232  1.0000000000000001e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.535647 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1060  hypothetical protein  33.17 
 
 		 213 aa  81.6  0.000000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1515  hypothetical protein  37.17 
 
 		 199 aa  73.9  0.0000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.120523  normal  0.0475034 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2275  hypothetical protein  36 
 
 		 229 aa  72  0.000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00081012  unclonable  0.000000000430819 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1271  hypothetical protein  41.67 
 
 		 240 aa  70.5  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1621  FHA domain-containing protein  36.47 
 
 		 230 aa  62.8  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.437766  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1006  hypothetical protein  37.21 
 
 		 90 aa  61.6  0.000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2271  FHA domain-containing protein  36.84 
 
 		 231 aa  60.8  0.000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0933302  hitchhiker  0.000000132679 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2117  hypothetical protein  31.9 
 
 		 132 aa  53.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2164  hypothetical protein  31.9 
 
 		 132 aa  53.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.473098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3295  hypothetical protein  31.67 
 
 		 88 aa  43.1  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2082  hypothetical protein  25.27 
 
 		 364 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.960469  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1074  hypothetical protein  35 
 
 		 603 aa  42  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.47301 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3357  hypothetical protein  25.33 
 
 		 205 aa  41.2  0.006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.000177334  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>