14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3315 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3315  hypothetical protein  100 
 
 		 158 aa  317  3.9999999999999996e-86  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.535647 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0053  hypothetical protein  74.38 
 
 		 161 aa  232  1.0000000000000001e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.275779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1515  hypothetical protein  40.87 
 
 		 199 aa  85.9  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.120523  normal  0.0475034 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1060  hypothetical protein  36.88 
 
 		 213 aa  80.9  0.000000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2275  hypothetical protein  38.39 
 
 		 229 aa  79  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00081012  unclonable  0.000000000430819 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2271  FHA domain-containing protein  40 
 
 		 231 aa  72.8  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0933302  hitchhiker  0.000000132679 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1271  hypothetical protein  44.44 
 
 		 240 aa  71.6  0.000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1621  FHA domain-containing protein  48.28 
 
 		 230 aa  67  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.437766  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1006  hypothetical protein  35.71 
 
 		 90 aa  60.5  0.000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2117  hypothetical protein  27.89 
 
 		 132 aa  52.4  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2164  hypothetical protein  27.89 
 
 		 132 aa  52.4  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.473098  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2082  hypothetical protein  28.26 
 
 		 364 aa  44.7  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.960469  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3357  hypothetical protein  26.53 
 
 		 205 aa  44.3  0.0007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.000177334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3295  hypothetical protein  33.33 
 
 		 88 aa  42.7  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>