13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_1006 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013525  Tter_1006  hypothetical protein  100 
 
 
90 aa  184  3e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0053  hypothetical protein  37.21 
 
 
161 aa  61.6  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.275779  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1271  hypothetical protein  38.16 
 
 
240 aa  62  0.000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3315  hypothetical protein  35.71 
 
 
158 aa  60.5  0.000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.535647 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1515  hypothetical protein  37.33 
 
 
199 aa  58.9  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.120523  normal  0.0475034 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2275  hypothetical protein  37.33 
 
 
229 aa  58.2  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00081012  unclonable  0.000000000430819 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2271  FHA domain-containing protein  30.95 
 
 
231 aa  52.4  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0933302  hitchhiker  0.000000132679 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1060  hypothetical protein  31.58 
 
 
213 aa  49.7  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1621  FHA domain-containing protein  32.18 
 
 
230 aa  48.5  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.437766  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3357  hypothetical protein  26.03 
 
 
205 aa  43.5  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.000177334  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2117  hypothetical protein  27.69 
 
 
132 aa  41.6  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2164  hypothetical protein  27.69 
 
 
132 aa  41.6  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.473098  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0253  valyl-tRNA synthetase  30 
 
 
904 aa  40  0.01  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>