15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1515 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1515  hypothetical protein  100 
 
 
199 aa  394  1e-109  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.120523  normal  0.0475034 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2275  hypothetical protein  66.16 
 
 
229 aa  224  7e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00081012  unclonable  0.000000000430819 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1060  hypothetical protein  47.57 
 
 
213 aa  150  1e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3315  hypothetical protein  39.01 
 
 
158 aa  87.8  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.535647 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0053  hypothetical protein  35.16 
 
 
161 aa  86.7  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.275779  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1271  hypothetical protein  46.15 
 
 
240 aa  79.7  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2271  FHA domain-containing protein  28.51 
 
 
231 aa  72.8  0.000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0933302  hitchhiker  0.000000132679 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1621  FHA domain-containing protein  45.71 
 
 
230 aa  66.6  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.437766  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1006  hypothetical protein  37.33 
 
 
90 aa  58.5  0.00000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2117  hypothetical protein  30.4 
 
 
132 aa  55.5  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2164  hypothetical protein  30.4 
 
 
132 aa  55.5  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.473098  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3357  hypothetical protein  37.5 
 
 
205 aa  50.4  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.000177334  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3295  hypothetical protein  37.7 
 
 
88 aa  45.1  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0376  hypothetical protein  32.39 
 
 
147 aa  43.9  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3466  SH3 type 3 domain-containing protein  39.71 
 
 
1281 aa  43.1  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.180669  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>