14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_3357 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_3357  hypothetical protein  100 
 
 
205 aa  423  1e-117  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.000177334  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0376  hypothetical protein  47.25 
 
 
147 aa  97.4  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2117  hypothetical protein  37.61 
 
 
132 aa  92.8  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2164  hypothetical protein  37.61 
 
 
132 aa  92.8  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.473098  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1074  hypothetical protein  38.27 
 
 
603 aa  72  0.000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.47301 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2082  hypothetical protein  34.12 
 
 
364 aa  70.5  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.960469  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1515  hypothetical protein  36.99 
 
 
199 aa  50.8  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.120523  normal  0.0475034 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2275  hypothetical protein  34.72 
 
 
229 aa  47.8  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00081012  unclonable  0.000000000430819 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4311  hypothetical protein  34.52 
 
 
323 aa  46.2  0.0003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1060  hypothetical protein  24.09 
 
 
213 aa  45.4  0.0006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3315  hypothetical protein  26.53 
 
 
158 aa  44.3  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.535647 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1006  hypothetical protein  26.03 
 
 
90 aa  43.5  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1545  hypothetical protein  24.51 
 
 
230 aa  41.6  0.008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0513126 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0053  hypothetical protein  25.33 
 
 
161 aa  41.2  0.01  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.275779  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>