187 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_1962 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_1962  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
140 aa  282  1.0000000000000001e-75  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.391056  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2926  GCN5-related N-acetyltransferase  70 
 
 
141 aa  191  3e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.834032  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3309  GCN5-related N-acetyltransferase  36.73 
 
 
150 aa  55.5  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1911  acetyltransferase  33.08 
 
 
363 aa  55.1  0.0000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3458  GCN5-related N-acetyltransferase  43.75 
 
 
153 aa  53.5  0.0000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.229516  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2257  acetyltransferase  28.24 
 
 
143 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.042527  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20240  acetyltransferase (GNAT) family protein  30.94 
 
 
244 aa  52.8  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.147961 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0450  GCN5-related N-acetyltransferase  53.45 
 
 
158 aa  52.4  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.158506  normal  0.429613 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20491  putatative acetyltransferase  32.06 
 
 
172 aa  52  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0667747  normal  0.264372 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0015  GCN5-related N-acetyltransferase  33.61 
 
 
153 aa  51.6  0.000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3114  acetyltransferase, GNAT family  29.55 
 
 
143 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.648197  hitchhiker  0.000000691419 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2211  acetyltransferase, GNAT family  29.55 
 
 
143 aa  51.2  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1633  GCN5-related N-acetyltransferase  28.79 
 
 
143 aa  50.8  0.000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00776574  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0667  GCN5-related N-acetyltransferase  36.67 
 
 
147 aa  50.8  0.000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2072  acetyltransferase  26.72 
 
 
143 aa  50.4  0.000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2011  acetyltransferase  26.72 
 
 
143 aa  50.4  0.000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0973618  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2227  acetyltransferase  26.72 
 
 
143 aa  50.4  0.000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0611  acetyltransferase  28.47 
 
 
155 aa  50.4  0.000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2255  acetyltransferase, GNAT family  26.72 
 
 
143 aa  50.4  0.000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.60781e-27 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2339  acetyltransferase, GNAT family  26.72 
 
 
143 aa  50.4  0.000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2010  acetyltransferase  26.72 
 
 
143 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.818769  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1723  aminoglycoside 6'-N-acetyltransferase Iz  34.25 
 
 
145 aa  50.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.173475 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3661  putative acetyltransferase  30.95 
 
 
146 aa  49.7  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.714516 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0797  GCN5-related N-acetyltransferase  30.5 
 
 
157 aa  50.1  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.64156  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1542  aminoglycoside 6'-N-acetyltransferase Iz  34.25 
 
 
145 aa  50.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0191  acetyltransferase  24.48 
 
 
142 aa  48.9  0.00002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1816  putative transmembrane protein  34.43 
 
 
148 aa  48.9  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2849  acetyltransferase  38.75 
 
 
153 aa  49.3  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1733  aminoglycoside 6'-N-acetyltransferase Iz  35.38 
 
 
145 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.247434  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1797  aminoglycoside 6'-N-acetyltransferase Iz  34.25 
 
 
145 aa  48.9  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1153  GCN5-related N-acetyltransferase  38 
 
 
148 aa  49.3  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1156  acetyltransferase  30.77 
 
 
369 aa  49.3  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1736  aminoglycoside 6'-N-acetyltransferase Iz  35.38 
 
 
145 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.771756  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3827  GCN5-related N-acetyltransferase  40.68 
 
 
151 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1761  putatative acetyltransferase  30.53 
 
 
172 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.389085  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2855  GCN5-related N-acetyltransferase  37.76 
 
 
173 aa  48.9  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0586  putative acetyltransferase  38.75 
 
 
147 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0321507  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6597  GCN5-related N-acetyltransferase  39.77 
 
 
171 aa  47.8  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1528  GCN5-related N-acetyltransferase  38.75 
 
 
154 aa  47.8  0.00005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2046  GCN5-related N-acetyltransferase  37.08 
 
 
156 aa  47.4  0.00006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06850  acetyltransferase  29.61 
 
 
154 aa  47.4  0.00006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2127  N-acetyltransferase  37.08 
 
 
157 aa  47.4  0.00007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2003  GCN5-related N-acetyltransferase  30.53 
 
 
171 aa  47  0.00008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5283  GCN5-related N-acetyltransferase  32.59 
 
 
143 aa  47  0.00008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11750  acetyltransferase  36.07 
 
 
153 aa  47  0.00009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.292363  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1589  GCN5-related N-acetyltransferase  36.25 
 
 
154 aa  47  0.00009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.276307  normal  0.605124 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0725  acetyltransferase, GNAT family  32.79 
 
 
156 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4993  GCN5-related N-acetyltransferase  34.43 
 
 
153 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.589527 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2803  GCN5-related N-acetyltransferase  32.46 
 
 
161 aa  46.6  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.409775  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1595  GCN5-related N-acetyltransferase  36.25 
 
 
154 aa  46.6  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.704694  normal  0.380148 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09200  acetyltransferase  44.83 
 
 
163 aa  46.6  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0795063  normal  0.698161 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4201  GCN5-related N-acetyltransferase  27.48 
 
 
157 aa  46.2  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.273149  normal  0.484115 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1615  GCN5-related N-acetyltransferase  39.73 
 
 
154 aa  46.2  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0957  putative acetyltransferase  30.23 
 
 
158 aa  46.6  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1079  acetyltransferase  36.07 
 
 
153 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.464221  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3590  GCN5-related protein N-acetyltransferase  47.54 
 
 
322 aa  46.6  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4357  GCN5-related N-acetyltransferase  48.89 
 
 
162 aa  45.4  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.676163  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2424  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  24.14 
 
 
148 aa  45.4  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2134  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  25.29 
 
 
148 aa  45.8  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2648  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  34.18 
 
 
154 aa  45.4  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.528414  normal  0.490077 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3033  GCN5-related N-acetyltransferase  28.97 
 
 
153 aa  45.1  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003393  histone acetyltransferase HPA2  29.07 
 
 
158 aa  45.1  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4095  GCN5-related N-acetyltransferase  40.32 
 
 
166 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1757  GCN5-related N-acetyltransferase  36.05 
 
 
155 aa  45.1  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2841  putative ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  49.12 
 
 
139 aa  45.1  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.000949861  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2754  GCN5-related N-acetyltransferase  30.37 
 
 
126 aa  44.7  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0911398  normal  0.0205687 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2119  GCN5-related N-acetyltransferase  25.26 
 
 
148 aa  44.7  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.175138  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0380  acetyltransferase  30.56 
 
 
151 aa  44.3  0.0005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.681432  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2649  GCN5-related N-acetyltransferase  42.86 
 
 
167 aa  44.7  0.0005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1290  GCN5-related N-acetyltransferase  29.23 
 
 
364 aa  44.3  0.0005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2769  GCN5-related N-acetyltransferase  29.86 
 
 
153 aa  44.3  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.55618  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0544  GCN5-related N-acetyltransferase  31.54 
 
 
146 aa  44.3  0.0005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4104  GCN5-related N-acetyltransferase  41.67 
 
 
170 aa  44.3  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0181775  normal  0.0340868 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1394  putative acetyltransferase  35.94 
 
 
141 aa  43.9  0.0006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.507407  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0166  acetyltransferase  26.92 
 
 
165 aa  44.3  0.0006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.903096 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1304  GCN5-related N-acetyltransferase  30.43 
 
 
169 aa  44.3  0.0006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0256127  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1227  acetyltransferase  29.7 
 
 
149 aa  43.9  0.0006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1281  putative acetyltransferase  35.94 
 
 
141 aa  43.9  0.0006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1473  putative acetyltransferase  40 
 
 
166 aa  44.3  0.0006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.195786  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4235  GCN5-related N-acetyltransferase  28.46 
 
 
162 aa  44.3  0.0006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.815435  normal  0.242045 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2783  putative acetyltransferase  35.94 
 
 
141 aa  43.9  0.0006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00321029 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1294  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  29.46 
 
 
154 aa  43.9  0.0007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.7344300000000002e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06300  GNAT family acetyltransferase  36.25 
 
 
147 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000128549  normal  0.32905 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0014  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  44.83 
 
 
147 aa  43.1  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00268172  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1149  acetyltransferase  35.82 
 
 
164 aa  43.5  0.001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1761  acetyltransferase  37.31 
 
 
191 aa  43.1  0.001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0969  GCN5-related N-acetyltransferase  24.62 
 
 
150 aa  43.1  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0852  GCN5-related N-acetyltransferase  35.29 
 
 
164 aa  42.7  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.537996 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0695  GCN5-related N-acetyltransferase  36.23 
 
 
183 aa  43.1  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0302476 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3293  GCN5-related N-acetyltransferase  40.48 
 
 
170 aa  43.5  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00428954  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2005  hypothetical protein  36.76 
 
 
267 aa  43.5  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.054169  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0586  GCN5-related N-acetyltransferase  32.79 
 
 
152 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.487283 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2948  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
180 aa  43.1  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1836  GCN5-related N-acetyltransferase  30.83 
 
 
166 aa  43.1  0.001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1403  GCN5-related N-acetyltransferase  31.43 
 
 
175 aa  42.4  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0574553  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3561  GCN5-related N-acetyltransferase  34.69 
 
 
152 aa  42.4  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.25811 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0380  acetyltransferase  26.74 
 
 
191 aa  42.7  0.002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.335252  hitchhiker  0.000000351254 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0580  GCN5-related N-acetyltransferase  31.15 
 
 
152 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.555179 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3457  GCN5-related N-acetyltransferase  34.18 
 
 
112 aa  42.4  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3135  GCN5-related N-acetyltransferase  30.77 
 
 
166 aa  42.7  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>