55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc2240 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc2240  hypothetical protein  100 
 
 		 96 aa  199  9.999999999999999e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2445  hypothetical protein  87.63 
 
 		 97 aa  175  2e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.418274  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2052  hypothetical protein  87.63 
 
 		 97 aa  175  2e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.717899  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5429  hypothetical protein  53.19 
 
 		 95 aa  94.7  4e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5733  hypothetical protein  51.61 
 
 		 94 aa  93.2  9e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.33633  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0553  hypothetical protein  44.57 
 
 		 94 aa  91.3  5e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0604448  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3936  hypothetical protein  46.74 
 
 		 94 aa  88.6  3e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.12055 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3823  hypothetical protein  46.74 
 
 		 94 aa  88.6  3e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.212047  normal  0.325504 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2700  hypothetical protein  45.65 
 
 		 94 aa  87.8  5e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.122057 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5190  hypothetical protein  45.16 
 
 		 95 aa  87  8e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2698  hypothetical protein  44.09 
 
 		 98 aa  86.3  1e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.220022 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0551  hypothetical protein  45.65 
 
 		 94 aa  86.3  1e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.216631  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5173  hypothetical protein  47.13 
 
 		 94 aa  83.2  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.733527 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3752  hypothetical protein  40.86 
 
 		 100 aa  80.5  0.000000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0599  hypothetical protein  45.45 
 
 		 94 aa  79.7  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.424494  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5593  hypothetical protein  44.74 
 
 		 110 aa  67.8  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5957  hypothetical protein  44.74 
 
 		 110 aa  67.8  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.070316 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0798  hypothetical protein  42.86 
 
 		 94 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.28473  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0810  hypothetical protein  42.86 
 
 		 94 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.74909  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6458  hypothetical protein  43.42 
 
 		 110 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.879585 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5800  hypothetical protein  43.42 
 
 		 94 aa  67  0.00000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.995119 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5583  hypothetical protein  43.42 
 
 		 94 aa  67  0.00000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7018  hypothetical protein  36.47 
 
 		 94 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0212876  hitchhiker  0.000503223 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0001  hypothetical protein  36.47 
 
 		 94 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000106232  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5373  hypothetical protein  40.79 
 
 		 94 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.573821 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5766  hypothetical protein  38.16 
 
 		 94 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00195148 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5093  hypothetical protein  38.16 
 
 		 94 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.725194  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4407  hypothetical protein  38.16 
 
 		 94 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4415  hypothetical protein  34.04 
 
 		 95 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5665  hypothetical protein  39.53 
 
 		 93 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1068  hypothetical protein  38.54 
 
 		 93 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.105369 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3441  hypothetical protein  38.3 
 
 		 94 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0980195  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2198  hypothetical protein  36.67 
 
 		 96 aa  52.4  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2610  hypothetical protein  33.72 
 
 		 95 aa  51.6  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.306006 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1527  hypothetical protein  33.72 
 
 		 95 aa  51.6  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.7915  normal  0.118728 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1127  hypothetical protein  35.53 
 
 		 94 aa  49.7  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0925384  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1136  hypothetical protein  35.53 
 
 		 94 aa  49.7  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.493987  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1292  hypothetical protein  35.53 
 
 		 293 aa  49.3  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0514  hypothetical protein  33.72 
 
 		 97 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0953  hypothetical protein  33.72 
 
 		 97 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0993  hypothetical protein  33.72 
 
 		 97 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.302174  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2074  hypothetical protein  31.4 
 
 		 98 aa  46.2  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.843349  normal  0.100319 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5663  hypothetical protein  32.18 
 
 		 95 aa  45.4  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.39165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1214  hypothetical protein  31.4 
 
 		 97 aa  46.2  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4162  hypothetical protein  29.79 
 
 		 97 aa  45.4  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4274  hypothetical protein  29.79 
 
 		 97 aa  45.4  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0604994  normal  0.323639 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0343  hypothetical protein  31.4 
 
 		 97 aa  45.4  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1223  hypothetical protein  31.4 
 
 		 97 aa  45.4  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.432721  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0808  hypothetical protein  31.4 
 
 		 97 aa  45.4  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1060  hypothetical protein  31.4 
 
 		 97 aa  45.4  0.0003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1373  hypothetical protein  31.4 
 
 		 97 aa  45.4  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1897  hypothetical protein  31.4 
 
 		 97 aa  45.4  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4097  hypothetical protein  30.23 
 
 		 97 aa  43.5  0.0009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.062282  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1004  hypothetical protein  29.89 
 
 		 282 aa  42.4  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3285  hypothetical protein  28.09 
 
 		 106 aa  42  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>