23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_1223 on replicon NC_009076
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006348  BMA1897  hypothetical protein  100 
 
 
97 aa  198  3e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1373  hypothetical protein  100 
 
 
97 aa  198  3e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0343  hypothetical protein  100 
 
 
97 aa  198  3e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1223  hypothetical protein  100 
 
 
97 aa  198  3e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.432721  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0808  hypothetical protein  100 
 
 
97 aa  198  3e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1060  hypothetical protein  100 
 
 
97 aa  198  3e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1214  hypothetical protein  97.94 
 
 
97 aa  195  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1004  hypothetical protein  91.75 
 
 
282 aa  187  2.9999999999999997e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2198  hypothetical protein  68.04 
 
 
96 aa  139  9e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4274  hypothetical protein  74.12 
 
 
97 aa  138  3e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0604994  normal  0.323639 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4162  hypothetical protein  74.12 
 
 
97 aa  138  3e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4097  hypothetical protein  67.01 
 
 
97 aa  138  3e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.062282  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2074  hypothetical protein  73.86 
 
 
98 aa  135  2e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.843349  normal  0.100319 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0853  hypothetical protein  68.04 
 
 
97 aa  134  5e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.268791  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0865  hypothetical protein  68.04 
 
 
97 aa  134  5e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.538046  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0993  hypothetical protein  64.95 
 
 
97 aa  131  3e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.302174  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0514  hypothetical protein  64.95 
 
 
97 aa  131  3e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0953  hypothetical protein  64.95 
 
 
97 aa  131  3e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3285  hypothetical protein  67.01 
 
 
106 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1260  hypothetical protein  62.24 
 
 
106 aa  118  3e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00830858  normal  0.311159 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2240  hypothetical protein  31.4 
 
 
96 aa  45.4  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2445  hypothetical protein  30.59 
 
 
97 aa  41.6  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.418274  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2052  hypothetical protein  30.59 
 
 
97 aa  41.6  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.717899  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>