23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_4162 on replicon NC_010678
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012857  Rpic12D_4274  hypothetical protein  100 
 
 		 97 aa  199  9e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0604994  normal  0.323639 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4162  hypothetical protein  100 
 
 		 97 aa  199  9e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2198  hypothetical protein  73.2 
 
 		 96 aa  149  2e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1004  hypothetical protein  69.07 
 
 		 282 aa  143  9e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1214  hypothetical protein  76.47 
 
 		 97 aa  140  4e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0808  hypothetical protein  74.12 
 
 		 97 aa  138  3e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0343  hypothetical protein  74.12 
 
 		 97 aa  138  3e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1223  hypothetical protein  74.12 
 
 		 97 aa  138  3e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.432721  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1060  hypothetical protein  74.12 
 
 		 97 aa  138  3e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1373  hypothetical protein  74.12 
 
 		 97 aa  138  3e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1897  hypothetical protein  74.12 
 
 		 97 aa  138  3e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4097  hypothetical protein  62.89 
 
 		 97 aa  133  8e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.062282  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0993  hypothetical protein  62.89 
 
 		 97 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.302174  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0514  hypothetical protein  62.89 
 
 		 97 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0953  hypothetical protein  62.89 
 
 		 97 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0853  hypothetical protein  65.26 
 
 		 97 aa  131  3e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.268791  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0865  hypothetical protein  65.26 
 
 		 97 aa  131  3e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.538046  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2074  hypothetical protein  66.67 
 
 		 98 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.843349  normal  0.100319 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1260  hypothetical protein  58.49 
 
 		 106 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00830858  normal  0.311159 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3285  hypothetical protein  57.14 
 
 		 106 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2240  hypothetical protein  29.79 
 
 		 96 aa  45.4  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2445  hypothetical protein  29.03 
 
 		 97 aa  41.6  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.418274  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2052  hypothetical protein  29.03 
 
 		 97 aa  41.6  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.717899  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>