21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A3285 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A3285  hypothetical protein  100 
 
 
106 aa  216  7e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1260  hypothetical protein  85.85 
 
 
106 aa  189  9e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00830858  normal  0.311159 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2074  hypothetical protein  62.04 
 
 
98 aa  131  3.9999999999999996e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.843349  normal  0.100319 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1004  hypothetical protein  66.33 
 
 
282 aa  131  3.9999999999999996e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4097  hypothetical protein  60 
 
 
97 aa  128  2.0000000000000002e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.062282  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0514  hypothetical protein  60.95 
 
 
97 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0993  hypothetical protein  60.95 
 
 
97 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.302174  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0953  hypothetical protein  60.95 
 
 
97 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1214  hypothetical protein  68.04 
 
 
97 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1373  hypothetical protein  67.01 
 
 
97 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1897  hypothetical protein  67.01 
 
 
97 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1060  hypothetical protein  67.01 
 
 
97 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0808  hypothetical protein  67.01 
 
 
97 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1223  hypothetical protein  67.01 
 
 
97 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.432721  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0343  hypothetical protein  67.01 
 
 
97 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0853  hypothetical protein  60.95 
 
 
97 aa  124  3e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.268791  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0865  hypothetical protein  60.95 
 
 
97 aa  124  3e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.538046  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4274  hypothetical protein  57.14 
 
 
97 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0604994  normal  0.323639 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4162  hypothetical protein  57.14 
 
 
97 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2198  hypothetical protein  59.14 
 
 
96 aa  111  3e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2240  hypothetical protein  28.09 
 
 
96 aa  42  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>