24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc2198 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc2198  hypothetical protein  100 
 
 		 96 aa  196  1.0000000000000001e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1004  hypothetical protein  72.16 
 
 		 282 aa  151  2.9999999999999998e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4274  hypothetical protein  73.2 
 
 		 97 aa  149  2e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0604994  normal  0.323639 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4162  hypothetical protein  73.2 
 
 		 97 aa  149  2e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1214  hypothetical protein  70.1 
 
 		 97 aa  142  1e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1060  hypothetical protein  68.04 
 
 		 97 aa  139  9e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0808  hypothetical protein  68.04 
 
 		 97 aa  139  9e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1373  hypothetical protein  68.04 
 
 		 97 aa  139  9e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1223  hypothetical protein  68.04 
 
 		 97 aa  139  9e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.432721  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0343  hypothetical protein  68.04 
 
 		 97 aa  139  9e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1897  hypothetical protein  68.04 
 
 		 97 aa  139  9e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4097  hypothetical protein  64.95 
 
 		 97 aa  133  7.000000000000001e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.062282  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0514  hypothetical protein  70.59 
 
 		 97 aa  128  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0853  hypothetical protein  69.41 
 
 		 97 aa  128  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.268791  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0993  hypothetical protein  70.59 
 
 		 97 aa  128  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.302174  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0953  hypothetical protein  70.59 
 
 		 97 aa  128  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0865  hypothetical protein  69.41 
 
 		 97 aa  128  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.538046  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2074  hypothetical protein  67.03 
 
 		 98 aa  124  6e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.843349  normal  0.100319 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3285  hypothetical protein  59.14 
 
 		 106 aa  111  3e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1260  hypothetical protein  56.6 
 
 		 106 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00830858  normal  0.311159 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2240  hypothetical protein  36.67 
 
 		 96 aa  52.4  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2445  hypothetical protein  34.83 
 
 		 97 aa  46.2  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.418274  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2052  hypothetical protein  34.83 
 
 		 97 aa  46.2  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.717899  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4644  hypothetical protein  37.14 
 
 		 84 aa  40.4  0.009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.661684  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>