25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A0599 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007347  Reut_A0599  hypothetical protein  100 
 
 
94 aa  194  3e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.424494  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5190  hypothetical protein  72.34 
 
 
95 aa  152  2e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5173  hypothetical protein  76.6 
 
 
94 aa  152  2e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.733527 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0551  hypothetical protein  57.14 
 
 
94 aa  119  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.216631  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2698  hypothetical protein  56.04 
 
 
98 aa  114  5e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.220022 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3936  hypothetical protein  54.35 
 
 
94 aa  112  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.12055 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3823  hypothetical protein  54.35 
 
 
94 aa  112  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.212047  normal  0.325504 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0553  hypothetical protein  50 
 
 
94 aa  109  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0604448  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2700  hypothetical protein  51.06 
 
 
94 aa  107  7.000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.122057 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5429  hypothetical protein  50.53 
 
 
95 aa  106  1e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5733  hypothetical protein  48.94 
 
 
94 aa  106  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.33633  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3752  hypothetical protein  46.67 
 
 
100 aa  93.6  8e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2052  hypothetical protein  46.59 
 
 
97 aa  80.9  0.000000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.717899  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2445  hypothetical protein  46.59 
 
 
97 aa  80.9  0.000000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.418274  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2240  hypothetical protein  45.45 
 
 
96 aa  79.7  0.00000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3441  hypothetical protein  42.53 
 
 
94 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0980195  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5665  hypothetical protein  38.71 
 
 
93 aa  57  0.00000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1068  hypothetical protein  38.71 
 
 
93 aa  57  0.00000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.105369 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1527  hypothetical protein  39.13 
 
 
95 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.7915  normal  0.118728 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0001  hypothetical protein  38.2 
 
 
94 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000106232  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2610  hypothetical protein  38.04 
 
 
95 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.306006 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7018  hypothetical protein  37.08 
 
 
94 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0212876  hitchhiker  0.000503223 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4415  hypothetical protein  32.61 
 
 
95 aa  51.6  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0810  hypothetical protein  30.12 
 
 
94 aa  42  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.74909  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0798  hypothetical protein  30.12 
 
 
94 aa  42  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.28473  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>