37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_0553 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_0553  hypothetical protein  100 
 
 		 94 aa  198  1.9999999999999998e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0604448  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2700  hypothetical protein  85.11 
 
 		 94 aa  170  6.999999999999999e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.122057 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3752  hypothetical protein  66.67 
 
 		 100 aa  141  3e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5733  hypothetical protein  55.32 
 
 		 94 aa  117  6e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.33633  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3936  hypothetical protein  54.35 
 
 		 94 aa  116  9e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.12055 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3823  hypothetical protein  54.35 
 
 		 94 aa  116  9e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.212047  normal  0.325504 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5429  hypothetical protein  52.63 
 
 		 95 aa  113  1.0000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2698  hypothetical protein  50.54 
 
 		 98 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.220022 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0599  hypothetical protein  50 
 
 		 94 aa  109  1.0000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.424494  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0551  hypothetical protein  47.31 
 
 		 94 aa  107  7.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.216631  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5190  hypothetical protein  44.68 
 
 		 95 aa  98.6  3e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5173  hypothetical protein  44.68 
 
 		 94 aa  96.7  9e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.733527 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2052  hypothetical protein  45.45 
 
 		 97 aa  91.7  4e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.717899  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2445  hypothetical protein  45.45 
 
 		 97 aa  91.7  4e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.418274  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2240  hypothetical protein  44.57 
 
 		 96 aa  91.3  5e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2610  hypothetical protein  33.71 
 
 		 95 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.306006 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3441  hypothetical protein  39.33 
 
 		 94 aa  60.8  0.000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0980195  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1527  hypothetical protein  33.71 
 
 		 95 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.7915  normal  0.118728 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1068  hypothetical protein  36.84 
 
 		 93 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.105369 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5665  hypothetical protein  36.36 
 
 		 93 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0001  hypothetical protein  34.09 
 
 		 94 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000106232  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7018  hypothetical protein  34.09 
 
 		 94 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0212876  hitchhiker  0.000503223 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4415  hypothetical protein  33.33 
 
 		 95 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0810  hypothetical protein  35.06 
 
 		 94 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.74909  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0798  hypothetical protein  35.06 
 
 		 94 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.28473  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6458  hypothetical protein  34.21 
 
 		 110 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.879585 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5957  hypothetical protein  36.36 
 
 		 110 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.070316 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5593  hypothetical protein  36.36 
 
 		 110 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5373  hypothetical protein  31.58 
 
 		 94 aa  48.5  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.573821 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5766  hypothetical protein  29.87 
 
 		 94 aa  46.2  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00195148 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5093  hypothetical protein  29.87 
 
 		 94 aa  46.2  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.725194  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5800  hypothetical protein  28.57 
 
 		 94 aa  45.8  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.995119 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5583  hypothetical protein  28.57 
 
 		 94 aa  45.8  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4407  hypothetical protein  28.57 
 
 		 94 aa  45.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1136  hypothetical protein  32.89 
 
 		 94 aa  44.3  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.493987  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1127  hypothetical protein  32.89 
 
 		 94 aa  44.3  0.0006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0925384  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1292  hypothetical protein  32.89 
 
 		 293 aa  44.3  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>