37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_5957 on replicon NC_008544
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008544  Bcen2424_5957  hypothetical protein  100 
 
 
110 aa  232  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.070316 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5593  hypothetical protein  100 
 
 
110 aa  232  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6458  hypothetical protein  94.5 
 
 
110 aa  219  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.879585 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5583  hypothetical protein  80.85 
 
 
94 aa  160  4.0000000000000004e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5800  hypothetical protein  80.85 
 
 
94 aa  160  4.0000000000000004e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.995119 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5373  hypothetical protein  75.82 
 
 
94 aa  147  6e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.573821 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0810  hypothetical protein  70.97 
 
 
94 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.74909  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0798  hypothetical protein  70.97 
 
 
94 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.28473  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4407  hypothetical protein  68.48 
 
 
94 aa  134  5e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5766  hypothetical protein  67.39 
 
 
94 aa  130  5e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00195148 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5093  hypothetical protein  67.39 
 
 
94 aa  130  5e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.725194  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1292  hypothetical protein  54.37 
 
 
293 aa  110  8.000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1127  hypothetical protein  57.45 
 
 
94 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0925384  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1136  hypothetical protein  57.45 
 
 
94 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.493987  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7018  hypothetical protein  55 
 
 
94 aa  94  6e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0212876  hitchhiker  0.000503223 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0001  hypothetical protein  56.25 
 
 
94 aa  94  6e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000106232  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5663  hypothetical protein  48.72 
 
 
95 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.39165  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5429  hypothetical protein  47.19 
 
 
95 aa  70.5  0.000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2240  hypothetical protein  44.74 
 
 
96 aa  67.8  0.00000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5733  hypothetical protein  44.74 
 
 
94 aa  64.3  0.0000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.33633  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1068  hypothetical protein  41.25 
 
 
93 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.105369 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5665  hypothetical protein  40.51 
 
 
93 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2445  hypothetical protein  41.03 
 
 
97 aa  62  0.000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.418274  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2052  hypothetical protein  41.03 
 
 
97 aa  62  0.000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.717899  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3936  hypothetical protein  39.47 
 
 
94 aa  58.9  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.12055 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3823  hypothetical protein  39.47 
 
 
94 aa  58.9  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.212047  normal  0.325504 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3441  hypothetical protein  38.27 
 
 
94 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0980195  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0553  hypothetical protein  36.36 
 
 
94 aa  53.5  0.0000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0604448  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4415  hypothetical protein  33.33 
 
 
95 aa  52.4  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0551  hypothetical protein  38.16 
 
 
94 aa  52.8  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.216631  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2700  hypothetical protein  35.44 
 
 
94 aa  52.8  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.122057 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2698  hypothetical protein  36.84 
 
 
98 aa  52.8  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.220022 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3752  hypothetical protein  36.71 
 
 
100 aa  52  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1527  hypothetical protein  32.47 
 
 
95 aa  50.1  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.7915  normal  0.118728 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5190  hypothetical protein  33.33 
 
 
95 aa  47.8  0.00005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2610  hypothetical protein  29.87 
 
 
95 aa  47.8  0.00006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.306006 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5173  hypothetical protein  32 
 
 
94 aa  44.7  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.733527 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>