38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_7018 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010676  Bphyt_7018  hypothetical protein  100 
 
 
94 aa  192  2e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0212876  hitchhiker  0.000503223 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0001  hypothetical protein  92.55 
 
 
94 aa  180  7e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000106232  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5583  hypothetical protein  57.5 
 
 
94 aa  100  6e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5800  hypothetical protein  57.5 
 
 
94 aa  100  6e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.995119 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0810  hypothetical protein  53.41 
 
 
94 aa  100  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.74909  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0798  hypothetical protein  53.41 
 
 
94 aa  100  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.28473  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5373  hypothetical protein  56.25 
 
 
94 aa  98.6  3e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.573821 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5093  hypothetical protein  55 
 
 
94 aa  97.8  4e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.725194  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5766  hypothetical protein  55 
 
 
94 aa  97.8  4e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00195148 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4407  hypothetical protein  53.75 
 
 
94 aa  97.1  7e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6458  hypothetical protein  55 
 
 
110 aa  94.7  4e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.879585 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5957  hypothetical protein  55 
 
 
110 aa  94  6e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.070316 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5593  hypothetical protein  55 
 
 
110 aa  94  6e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5665  hypothetical protein  47.87 
 
 
93 aa  90.1  9e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1068  hypothetical protein  47.87 
 
 
93 aa  89.4  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.105369 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5663  hypothetical protein  50 
 
 
95 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.39165  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3441  hypothetical protein  46.32 
 
 
94 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0980195  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1127  hypothetical protein  48.75 
 
 
94 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0925384  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1136  hypothetical protein  48.75 
 
 
94 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.493987  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1292  hypothetical protein  51.32 
 
 
293 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2700  hypothetical protein  40.91 
 
 
94 aa  66.6  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.122057 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5429  hypothetical protein  40.86 
 
 
95 aa  64.7  0.0000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2240  hypothetical protein  36.47 
 
 
96 aa  63.5  0.0000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5190  hypothetical protein  40.7 
 
 
95 aa  63.5  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4415  hypothetical protein  38.1 
 
 
95 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3936  hypothetical protein  37.5 
 
 
94 aa  61.6  0.000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.12055 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3823  hypothetical protein  37.5 
 
 
94 aa  61.6  0.000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.212047  normal  0.325504 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1527  hypothetical protein  34.48 
 
 
95 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.7915  normal  0.118728 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5173  hypothetical protein  38.37 
 
 
94 aa  58.9  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.733527 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3752  hypothetical protein  35.63 
 
 
100 aa  58.9  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5733  hypothetical protein  38.64 
 
 
94 aa  59.3  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.33633  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2610  hypothetical protein  33.33 
 
 
95 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.306006 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2445  hypothetical protein  36.9 
 
 
97 aa  58.5  0.00000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.418274  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2052  hypothetical protein  36.9 
 
 
97 aa  58.5  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.717899  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0551  hypothetical protein  34.52 
 
 
94 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.216631  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0553  hypothetical protein  34.09 
 
 
94 aa  56.2  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0604448  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0599  hypothetical protein  37.08 
 
 
94 aa  53.9  0.0000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.424494  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2698  hypothetical protein  34.52 
 
 
98 aa  52.4  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.220022 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>