47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc1523 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc1523  hypothetical protein  100 
 
 		 155 aa  305  1.0000000000000001e-82  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.934118  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1724  hypothetical protein  84.52 
 
 		 155 aa  253  6e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2032  putative transmembrane protein  84.52 
 
 		 155 aa  235  2e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2191  hypothetical protein  55.92 
 
 		 163 aa  174  5e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00524739  normal  0.0689108 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1612  hypothetical protein  61.74 
 
 		 167 aa  168  3e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1509  hypothetical protein  61.74 
 
 		 167 aa  168  3e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1479  hypothetical protein  61.74 
 
 		 167 aa  168  3e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.241706  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0876  hypothetical protein  60.54 
 
 		 166 aa  166  1e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.810524  normal  0.0626791 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2173  transmembrane protein  59.6 
 
 		 167 aa  166  1e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1294  hypothetical protein  57.82 
 
 		 152 aa  165  2e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4436  hypothetical protein  57.82 
 
 		 152 aa  165  2e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0813  hypothetical protein  57.82 
 
 		 152 aa  165  2e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1265  hypothetical protein  57.82 
 
 		 152 aa  165  2e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.238784 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1171  hypothetical protein  57.82 
 
 		 155 aa  164  5e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2779  hypothetical protein  61.07 
 
 		 167 aa  164  5e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.333542  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0774  hypothetical protein  61.07 
 
 		 167 aa  163  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.46119  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1285  hypothetical protein  61.07 
 
 		 167 aa  163  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.137932  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0583  hypothetical protein  61.07 
 
 		 167 aa  163  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.372636  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0568  hypothetical protein  61.07 
 
 		 167 aa  163  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.399783  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2865  hypothetical protein  58.78 
 
 		 169 aa  162  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0570173  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1259  hypothetical protein  59.46 
 
 		 169 aa  163  1.0000000000000001e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1183  hypothetical protein  57.14 
 
 		 152 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.226731 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2026  hypothetical protein  55.78 
 
 		 152 aa  159  1e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1016  hypothetical protein  39.86 
 
 		 160 aa  124  4.0000000000000003e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0781  hypothetical protein  45.03 
 
 		 151 aa  106  1e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000248599  hitchhiker  0.0000184506 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0941  hypothetical protein  41.29 
 
 		 153 aa  102  1e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1130  hypothetical protein  44.29 
 
 		 152 aa  91.7  3e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1264  hypothetical protein  37.18 
 
 		 152 aa  69.7  0.00000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0257233 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2620  hypothetical protein  56.45 
 
 		 140 aa  63.9  0.0000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.224244  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4929  hypothetical protein  30.77 
 
 		 147 aa  63.2  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.309101 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1145  hypothetical protein  30.92 
 
 		 144 aa  61.2  0.000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2613  hypothetical protein  32.47 
 
 		 136 aa  60.8  0.000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.639922 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3306  hypothetical protein  32.03 
 
 		 146 aa  56.2  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000316437  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2008  hypothetical protein  31.08 
 
 		 136 aa  55.5  0.0000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.299428  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2388  hypothetical protein  30.67 
 
 		 137 aa  54.3  0.0000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.558847  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3199  hypothetical protein  28.95 
 
 		 172 aa  53.5  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0105261  normal  0.958543 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1470  hypothetical protein  30 
 
 		 137 aa  53.1  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1796  hypothetical protein  28.57 
 
 		 146 aa  50.4  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00356379  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3423  hypothetical protein  26.56 
 
 		 146 aa  49.3  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1773  hypothetical protein  32.26 
 
 		 165 aa  48.1  0.00004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.245103  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1979  hypothetical protein  32.84 
 
 		 150 aa  48.1  0.00004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00766685 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1777  putative transmembrane protein  37.96 
 
 		 146 aa  47.8  0.00005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0109085 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1649  hypothetical protein  25.4 
 
 		 181 aa  47.8  0.00006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3484  hypothetical protein  28.12 
 
 		 146 aa  46.2  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000556959 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2820  hypothetical protein  35.42 
 
 		 151 aa  45.4  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0851  conserved hypothetical membrane spanning protein  42.11 
 
 		 63 aa  44.3  0.0006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.276761 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2676  putative transmembrane protein  41.94 
 
 		 151 aa  42  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>