38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_1130 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_1130  hypothetical protein  100 
 
 		 152 aa  293  6e-79  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0781  hypothetical protein  57.43 
 
 		 151 aa  165  2e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000248599  hitchhiker  0.0000184506 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0941  hypothetical protein  53.79 
 
 		 153 aa  154  6e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1523  hypothetical protein  44.29 
 
 		 155 aa  106  1e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.934118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2191  hypothetical protein  43.45 
 
 		 163 aa  106  1e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00524739  normal  0.0689108 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1724  hypothetical protein  43.87 
 
 		 155 aa  105  2e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1016  hypothetical protein  35.06 
 
 		 160 aa  95.5  2e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2032  putative transmembrane protein  46.21 
 
 		 155 aa  94.4  5e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1171  hypothetical protein  39.01 
 
 		 155 aa  90.5  8e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1265  hypothetical protein  38.57 
 
 		 152 aa  90.1  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.238784 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1294  hypothetical protein  38.57 
 
 		 152 aa  90.1  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1183  hypothetical protein  39.01 
 
 		 152 aa  89.7  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.226731 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0813  hypothetical protein  38.57 
 
 		 152 aa  90.1  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0876  hypothetical protein  40 
 
 		 166 aa  89.4  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.810524  normal  0.0626791 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4436  hypothetical protein  39.29 
 
 		 152 aa  89.4  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2026  hypothetical protein  39.01 
 
 		 152 aa  88.6  3e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2173  transmembrane protein  42.36 
 
 		 167 aa  87.8  5e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1612  hypothetical protein  40 
 
 		 167 aa  85.1  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1509  hypothetical protein  40 
 
 		 167 aa  85.1  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1479  hypothetical protein  40 
 
 		 167 aa  85.1  3e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.241706  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1259  hypothetical protein  40 
 
 		 169 aa  84.7  4e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1285  hypothetical protein  38.46 
 
 		 167 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.137932  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2865  hypothetical protein  39.29 
 
 		 169 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0570173  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0568  hypothetical protein  38.46 
 
 		 167 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.399783  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0583  hypothetical protein  38.46 
 
 		 167 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.372636  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0774  hypothetical protein  38.46 
 
 		 167 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.46119  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2779  hypothetical protein  37.86 
 
 		 167 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.333542  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4929  hypothetical protein  33.09 
 
 		 147 aa  62.8  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.309101 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1145  hypothetical protein  26.39 
 
 		 144 aa  52.4  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2620  hypothetical protein  31.08 
 
 		 140 aa  52.8  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.224244  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2388  hypothetical protein  32.28 
 
 		 137 aa  50.4  0.000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.558847  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2613  hypothetical protein  29.05 
 
 		 136 aa  49.3  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.639922 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1470  hypothetical protein  31.5 
 
 		 137 aa  48.9  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1979  hypothetical protein  31.34 
 
 		 150 aa  48.1  0.00004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00766685 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2008  hypothetical protein  30.95 
 
 		 136 aa  47.8  0.00005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.299428  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3199  hypothetical protein  35.29 
 
 		 172 aa  45.8  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0105261  normal  0.958543 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1264  hypothetical protein  30 
 
 		 152 aa  45.4  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0257233 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3306  hypothetical protein  27.82 
 
 		 146 aa  42.4  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000316437  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>