30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_1979 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_1979  hypothetical protein  100 
 
 
150 aa  293  6e-79  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00766685 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1773  hypothetical protein  40.14 
 
 
165 aa  74.7  0.0000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.245103  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0781  hypothetical protein  33.58 
 
 
151 aa  66.2  0.0000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000248599  hitchhiker  0.0000184506 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0876  hypothetical protein  33.12 
 
 
166 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.810524  normal  0.0626791 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0774  hypothetical protein  37.41 
 
 
167 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.46119  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2026  hypothetical protein  33.08 
 
 
152 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1016  hypothetical protein  31.34 
 
 
160 aa  59.3  0.00000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0568  hypothetical protein  37.41 
 
 
167 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.399783  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0583  hypothetical protein  37.41 
 
 
167 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.372636  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1285  hypothetical protein  37.41 
 
 
167 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.137932  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2191  hypothetical protein  35.37 
 
 
163 aa  59.3  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00524739  normal  0.0689108 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0813  hypothetical protein  33.08 
 
 
152 aa  58.2  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1294  hypothetical protein  33.08 
 
 
152 aa  58.2  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1265  hypothetical protein  33.08 
 
 
152 aa  58.2  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.238784 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1183  hypothetical protein  33.08 
 
 
152 aa  57.8  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.226731 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1171  hypothetical protein  33.08 
 
 
155 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4436  hypothetical protein  33.08 
 
 
152 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2865  hypothetical protein  32.61 
 
 
169 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0570173  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1259  hypothetical protein  32.61 
 
 
169 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1612  hypothetical protein  37.58 
 
 
167 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1479  hypothetical protein  37.58 
 
 
167 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.241706  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1509  hypothetical protein  37.58 
 
 
167 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0941  hypothetical protein  31.69 
 
 
153 aa  57.4  0.00000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1724  hypothetical protein  35.17 
 
 
155 aa  55.1  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2779  hypothetical protein  35.81 
 
 
167 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.333542  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1523  hypothetical protein  33.58 
 
 
155 aa  51.2  0.000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.934118  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1130  hypothetical protein  38.82 
 
 
152 aa  48.1  0.00004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2173  transmembrane protein  33.08 
 
 
167 aa  47  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2032  putative transmembrane protein  38.68 
 
 
155 aa  46.6  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0094  hypothetical protein  26.61 
 
 
132 aa  43.5  0.001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>