42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_1171 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008390  Bamb_1171  hypothetical protein  100 
 
 		 155 aa  310  4.999999999999999e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1183  hypothetical protein  99.34 
 
 		 152 aa  303  8.000000000000001e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.226731 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2026  hypothetical protein  94.08 
 
 		 152 aa  293  8e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1265  hypothetical protein  94.74 
 
 		 152 aa  291  2e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.238784 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0813  hypothetical protein  94.74 
 
 		 152 aa  291  2e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1294  hypothetical protein  94.74 
 
 		 152 aa  291  2e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4436  hypothetical protein  94.08 
 
 		 152 aa  291  3e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2865  hypothetical protein  73.83 
 
 		 169 aa  238  2e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0570173  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0876  hypothetical protein  72.9 
 
 		 166 aa  237  4e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.810524  normal  0.0626791 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1259  hypothetical protein  73.15 
 
 		 169 aa  237  4e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1612  hypothetical protein  71.9 
 
 		 167 aa  227  6e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1509  hypothetical protein  71.9 
 
 		 167 aa  227  6e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1479  hypothetical protein  71.9 
 
 		 167 aa  227  6e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.241706  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2779  hypothetical protein  72.48 
 
 		 167 aa  225  2e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.333542  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1285  hypothetical protein  71.24 
 
 		 167 aa  223  7e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.137932  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0774  hypothetical protein  71.24 
 
 		 167 aa  223  7e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.46119  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0583  hypothetical protein  71.24 
 
 		 167 aa  223  7e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.372636  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0568  hypothetical protein  71.24 
 
 		 167 aa  223  7e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.399783  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2191  hypothetical protein  57.14 
 
 		 163 aa  170  5.999999999999999e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00524739  normal  0.0689108 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1523  hypothetical protein  57.82 
 
 		 155 aa  164  5e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.934118  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1724  hypothetical protein  57.14 
 
 		 155 aa  163  1.0000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2173  transmembrane protein  55.63 
 
 		 167 aa  155  2e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2032  putative transmembrane protein  57.14 
 
 		 155 aa  148  3e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1016  hypothetical protein  41.1 
 
 		 160 aa  119  9.999999999999999e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0781  hypothetical protein  41.3 
 
 		 151 aa  93.6  9e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000248599  hitchhiker  0.0000184506 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0941  hypothetical protein  37.96 
 
 		 153 aa  75.1  0.0000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1130  hypothetical protein  39.01 
 
 		 152 aa  72.8  0.000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1264  hypothetical protein  37.75 
 
 		 152 aa  71.6  0.000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0257233 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1649  hypothetical protein  26.9 
 
 		 181 aa  55.8  0.0000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1979  hypothetical protein  31.06 
 
 		 150 aa  53.1  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00766685 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1796  hypothetical protein  27.78 
 
 		 146 aa  51.6  0.000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00356379  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2008  hypothetical protein  31.51 
 
 		 136 aa  51.6  0.000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.299428  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3306  hypothetical protein  28.35 
 
 		 146 aa  50.8  0.000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000316437  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2820  hypothetical protein  37.59 
 
 		 151 aa  50.8  0.000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2620  hypothetical protein  45.9 
 
 		 140 aa  49.7  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.224244  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2613  hypothetical protein  29.61 
 
 		 136 aa  48.9  0.00003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.639922 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4929  hypothetical protein  26.58 
 
 		 147 aa  47.4  0.00008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.309101 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3423  hypothetical protein  24.41 
 
 		 146 aa  45.8  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1145  hypothetical protein  38.1 
 
 		 144 aa  44.3  0.0006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3484  hypothetical protein  26.77 
 
 		 146 aa  43.5  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000556959 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2388  hypothetical protein  29.14 
 
 		 137 aa  41.2  0.005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.558847  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1470  hypothetical protein  32.47 
 
 		 137 aa  40.8  0.006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>