24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_3423 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_3423  hypothetical protein  100 
 
 		 146 aa  290  5e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3484  hypothetical protein  93.15 
 
 		 146 aa  273  4e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000556959 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1045  hypothetical protein  69.18 
 
 		 146 aa  201  3e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.362195  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3306  hypothetical protein  63.01 
 
 		 146 aa  197  3e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000316437  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0715  hypothetical protein  65.75 
 
 		 146 aa  185  2e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1796  hypothetical protein  58.22 
 
 		 146 aa  182  2.0000000000000003e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00356379  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_40063  predicted protein  26.8 
 
 		 247 aa  58.2  0.00000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1523  hypothetical protein  26.56 
 
 		 155 aa  49.3  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.934118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2191  hypothetical protein  29.03 
 
 		 163 aa  49.3  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00524739  normal  0.0689108 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0813  hypothetical protein  25.98 
 
 		 152 aa  48.9  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1294  hypothetical protein  25.98 
 
 		 152 aa  48.9  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1265  hypothetical protein  25.98 
 
 		 152 aa  48.9  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.238784 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2173  transmembrane protein  29.13 
 
 		 167 aa  47.8  0.00005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2032  putative transmembrane protein  25.98 
 
 		 155 aa  47.4  0.00007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4436  hypothetical protein  24.41 
 
 		 152 aa  47  0.00008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1724  hypothetical protein  25.2 
 
 		 155 aa  47  0.00008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1171  hypothetical protein  24.41 
 
 		 155 aa  45.8  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1183  hypothetical protein  24.41 
 
 		 152 aa  45.4  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.226731 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2026  hypothetical protein  23.62 
 
 		 152 aa  44.7  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0094  hypothetical protein  30.65 
 
 		 132 aa  44.3  0.0005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0941  hypothetical protein  29.85 
 
 		 153 aa  43.9  0.0007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3199  hypothetical protein  27.14 
 
 		 172 aa  42.7  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0105261  normal  0.958543 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0075  hypothetical protein  27.2 
 
 		 170 aa  42  0.003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0876  hypothetical protein  25.2 
 
 		 166 aa  40.8  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.810524  normal  0.0626791 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>