25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_3484 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_3484  hypothetical protein  100 
 
 		 146 aa  288  1e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000556959 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3423  hypothetical protein  93.15 
 
 		 146 aa  273  4e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3306  hypothetical protein  63.7 
 
 		 146 aa  199  9.999999999999999e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000316437  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1045  hypothetical protein  68.49 
 
 		 146 aa  199  9.999999999999999e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.362195  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0715  hypothetical protein  65.75 
 
 		 146 aa  186  9e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1796  hypothetical protein  56.16 
 
 		 146 aa  179  8.000000000000001e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00356379  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_40063  predicted protein  28.76 
 
 		 247 aa  63.5  0.0000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2173  transmembrane protein  31.5 
 
 		 167 aa  50.8  0.000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2191  hypothetical protein  29.77 
 
 		 163 aa  47  0.00009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00524739  normal  0.0689108 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1265  hypothetical protein  28.35 
 
 		 152 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.238784 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1294  hypothetical protein  28.35 
 
 		 152 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0813  hypothetical protein  28.35 
 
 		 152 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1523  hypothetical protein  28.12 
 
 		 155 aa  46.2  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.934118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4436  hypothetical protein  26.77 
 
 		 152 aa  45.1  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0094  hypothetical protein  30.4 
 
 		 132 aa  45.1  0.0003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2032  putative transmembrane protein  27.56 
 
 		 155 aa  44.7  0.0005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0075  hypothetical protein  30.08 
 
 		 170 aa  44.7  0.0005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1724  hypothetical protein  26.77 
 
 		 155 aa  43.9  0.0007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1183  hypothetical protein  26.77 
 
 		 152 aa  43.9  0.0008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.226731 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1171  hypothetical protein  26.77 
 
 		 155 aa  43.5  0.0009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2026  hypothetical protein  25.98 
 
 		 152 aa  43.1  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0941  hypothetical protein  27.94 
 
 		 153 aa  43.1  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0876  hypothetical protein  27.56 
 
 		 166 aa  42  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.810524  normal  0.0626791 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3199  hypothetical protein  26.4 
 
 		 172 aa  42  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0105261  normal  0.958543 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0781  hypothetical protein  27.54 
 
 		 151 aa  41.6  0.004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000248599  hitchhiker  0.0000184506 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>