24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU1045 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1045  hypothetical protein  100 
 
 		 146 aa  292  1e-78  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.362195  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0715  hypothetical protein  85.62 
 
 		 146 aa  237  2.9999999999999997e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3423  hypothetical protein  69.18 
 
 		 146 aa  211  3.9999999999999995e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3306  hypothetical protein  66.44 
 
 		 146 aa  210  4.9999999999999996e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000316437  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3484  hypothetical protein  68.49 
 
 		 146 aa  209  1e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000556959 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1796  hypothetical protein  61.64 
 
 		 146 aa  194  3e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00356379  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_40063  predicted protein  31.72 
 
 		 247 aa  59.3  0.00000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2173  transmembrane protein  29.6 
 
 		 167 aa  48.9  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1724  hypothetical protein  30 
 
 		 155 aa  48.5  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0075  hypothetical protein  30.65 
 
 		 170 aa  48.1  0.00004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2032  putative transmembrane protein  29.23 
 
 		 155 aa  47.4  0.00007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1523  hypothetical protein  29.92 
 
 		 155 aa  46.2  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.934118  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0094  hypothetical protein  23.85 
 
 		 132 aa  46.6  0.0001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3199  hypothetical protein  26.53 
 
 		 172 aa  45.4  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0105261  normal  0.958543 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4436  hypothetical protein  28.68 
 
 		 152 aa  45.1  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2191  hypothetical protein  26.56 
 
 		 163 aa  43.9  0.0008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00524739  normal  0.0689108 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2026  hypothetical protein  29.46 
 
 		 152 aa  43.5  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1265  hypothetical protein  27.97 
 
 		 152 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.238784 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1294  hypothetical protein  27.97 
 
 		 152 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0813  hypothetical protein  27.97 
 
 		 152 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0941  hypothetical protein  32.28 
 
 		 153 aa  43.1  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1183  hypothetical protein  28.68 
 
 		 152 aa  42  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.226731 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1171  hypothetical protein  28.68 
 
 		 155 aa  41.6  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1229  hypothetical protein  27.91 
 
 		 132 aa  40  0.009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0813009  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>