35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_1796 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_1796  hypothetical protein  100 
 
 		 146 aa  289  9e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00356379  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1045  hypothetical protein  61.64 
 
 		 146 aa  186  1e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.362195  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0715  hypothetical protein  62.33 
 
 		 146 aa  184  2e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3306  hypothetical protein  57.53 
 
 		 146 aa  184  4e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000316437  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3423  hypothetical protein  58.22 
 
 		 146 aa  182  2.0000000000000003e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3484  hypothetical protein  56.16 
 
 		 146 aa  179  8.000000000000001e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000556959 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_40063  predicted protein  31.29 
 
 		 247 aa  55.5  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0813  hypothetical protein  28.57 
 
 		 152 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1294  hypothetical protein  28.57 
 
 		 152 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1265  hypothetical protein  28.57 
 
 		 152 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.238784 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4436  hypothetical protein  27.78 
 
 		 152 aa  53.1  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2173  transmembrane protein  29.69 
 
 		 167 aa  52  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0075  hypothetical protein  29.84 
 
 		 170 aa  51.6  0.000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1171  hypothetical protein  27.78 
 
 		 155 aa  51.6  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0876  hypothetical protein  28.57 
 
 		 166 aa  51.6  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.810524  normal  0.0626791 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1183  hypothetical protein  27.78 
 
 		 152 aa  51.6  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.226731 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1724  hypothetical protein  30.95 
 
 		 155 aa  51.2  0.000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2026  hypothetical protein  26.19 
 
 		 152 aa  50.8  0.000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2032  putative transmembrane protein  30.95 
 
 		 155 aa  50.4  0.000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1523  hypothetical protein  28.57 
 
 		 155 aa  50.4  0.000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.934118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1259  hypothetical protein  30.16 
 
 		 169 aa  48.9  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1509  hypothetical protein  29.37 
 
 		 167 aa  48.1  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1479  hypothetical protein  29.37 
 
 		 167 aa  48.1  0.00004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.241706  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1612  hypothetical protein  29.37 
 
 		 167 aa  48.1  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0568  hypothetical protein  28.79 
 
 		 167 aa  47.8  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.399783  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0583  hypothetical protein  28.79 
 
 		 167 aa  47.8  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.372636  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1285  hypothetical protein  28.79 
 
 		 167 aa  47.8  0.00005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.137932  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2865  hypothetical protein  30.4 
 
 		 169 aa  47.8  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0570173  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0774  hypothetical protein  28.79 
 
 		 167 aa  47.8  0.00005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.46119  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0941  hypothetical protein  31.3 
 
 		 153 aa  47.4  0.00006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2779  hypothetical protein  28.57 
 
 		 167 aa  47.4  0.00007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.333542  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0094  hypothetical protein  25 
 
 		 132 aa  45.4  0.0003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2191  hypothetical protein  25.98 
 
 		 163 aa  43.5  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00524739  normal  0.0689108 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1016  hypothetical protein  25.78 
 
 		 160 aa  40.8  0.006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3199  hypothetical protein  22.73 
 
 		 172 aa  40.4  0.008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0105261  normal  0.958543 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>