More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_1588 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007493  RSP_1588  chemotaxis methylesterase, CheB1  100 
 
 
369 aa  733    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0240  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  100 
 
 
369 aa  733    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0268  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  92.45 
 
 
371 aa  664    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.669783 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1145  protein-glutamate methylesterase  56.9 
 
 
354 aa  369  1e-101  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00201495  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2418  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheB methylesterase  55.84 
 
 
355 aa  367  1e-100  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.033  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1406  two component CheB methylesterase  56.51 
 
 
363 aa  367  1e-100  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.890909  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0626  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  52.56 
 
 
394 aa  367  1e-100  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7833  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  57.63 
 
 
364 aa  363  3e-99  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2616  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  53.8 
 
 
356 aa  363  3e-99  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1597  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  54.29 
 
 
356 aa  362  5.0000000000000005e-99  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0878  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  55.59 
 
 
378 aa  362  8e-99  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4309  protein-glutamate methylesterase  53.91 
 
 
364 aa  360  2e-98  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2982  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  54.57 
 
 
355 aa  360  3e-98  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4668  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheB methylesterase  56.08 
 
 
368 aa  352  7e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.275647  normal  0.417373 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3257  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  53.61 
 
 
365 aa  351  1e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.238845  normal  0.250549 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1383  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheB methylesterase  55.59 
 
 
362 aa  351  1e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3556  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  53.06 
 
 
365 aa  351  1e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.386097  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4820  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  55.74 
 
 
361 aa  350  3e-95  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.305124  hitchhiker  0.00546369 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0140  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  54.06 
 
 
363 aa  348  7e-95  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0298579  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0618  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  53.55 
 
 
371 aa  348  1e-94  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2104  response regulator receiver domain-containing protein  54.73 
 
 
356 aa  346  3e-94  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2570  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  54.8 
 
 
362 aa  347  3e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6730  chemotaxis response regulator protein CheB-glutamate methylesterase  53.78 
 
 
364 aa  347  3e-94  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.324062  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1730  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  52.86 
 
 
354 aa  346  5e-94  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2474  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  55.34 
 
 
362 aa  345  7e-94  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0236682  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1538  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  53.87 
 
 
357 aa  342  5e-93  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.30172  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1611  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  52.27 
 
 
356 aa  338  9.999999999999999e-92  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.225  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0465  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  55.27 
 
 
356 aa  337  1.9999999999999998e-91  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.410999 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1428  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  50.28 
 
 
356 aa  337  2.9999999999999997e-91  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.218865  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1148  chemotaxis-specific methylesterase  49.44 
 
 
359 aa  332  8e-90  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.870616  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0906  chemotaxis-specific methylesterase  52.72 
 
 
351 aa  331  1e-89  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3220  chemotaxis-specific methylesterase  48.34 
 
 
363 aa  321  1.9999999999999998e-86  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.184496 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3801  chemotaxis-specific methylesterase  51.58 
 
 
350 aa  318  1e-85  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1041  chemotaxis-specific methylesterase  48.62 
 
 
363 aa  317  2e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2327  chemotaxis-specific methylesterase  47.46 
 
 
356 aa  315  6e-85  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0908  protein-glutamate methylesterase CheB  48.73 
 
 
358 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1075  chemotaxis-specific methylesterase  48.2 
 
 
363 aa  312  5.999999999999999e-84  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00340521 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0781  chemotaxis-specific methylesterase  48.29 
 
 
358 aa  311  1e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.475096 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3548  chemotaxis-specific methylesterase  51.57 
 
 
358 aa  310  2e-83  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.422296  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2980  chemotaxis-specific methylesterase  49.28 
 
 
349 aa  310  2.9999999999999997e-83  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04755  chemotaxis-specific methylesterase  49.44 
 
 
379 aa  307  2.0000000000000002e-82  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3301  protein-glutamate methylesterase  46.99 
 
 
358 aa  306  4.0000000000000004e-82  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3177  chemotaxis-specific methylesterase  48.7 
 
 
364 aa  300  3e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2854  chemotaxis-specific methylesterase  48.7 
 
 
364 aa  299  6e-80  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1615  chemotaxis-specific methylesterase  45.96 
 
 
356 aa  299  6e-80  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0606419 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0071  chemotaxis-specific methylesterase  48.7 
 
 
364 aa  299  6e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3850  chemotaxis-specific methylesterase  48.7 
 
 
364 aa  299  6e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3931  chemotaxis-specific methylesterase  48.7 
 
 
364 aa  299  6e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3429  chemotaxis-specific methylesterase  48.7 
 
 
364 aa  299  6e-80  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1689  chemotaxis-specific methylesterase  48.7 
 
 
364 aa  299  6e-80  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.21493  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2165  chemotaxis-specific methylesterase  45.53 
 
 
362 aa  296  3e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000178188  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2176  chemotaxis-specific methylesterase  46.97 
 
 
349 aa  296  3e-79  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0644  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  53.67 
 
 
358 aa  296  5e-79  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.173945  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1544  chemotaxis-specific methylesterase  48.42 
 
 
350 aa  296  5e-79  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.381226  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3363  chemotaxis-specific methylesterase  47.74 
 
 
363 aa  295  7e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0170519  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27980  chemotaxis response regulator; CheB  48.3 
 
 
353 aa  295  7e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.151486  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1757  chemotaxis-specific methylesterase  47.56 
 
 
349 aa  295  1e-78  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.982649  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1645  chemotaxis-specific methylesterase  47.56 
 
 
349 aa  295  1e-78  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4166  chemotaxis-specific methylesterase  47.09 
 
 
375 aa  295  1e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.904429  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4054  chemotaxis-specific methylesterase  47.09 
 
 
375 aa  295  1e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3519  chemotaxis-specific methylesterase  47.56 
 
 
349 aa  295  1e-78  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.480358 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0187  chemotaxis-specific methylesterase  47.74 
 
 
363 aa  295  1e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2621  chemotaxis-specific methylesterase  46.42 
 
 
349 aa  294  2e-78  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000506638 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2116  chemotaxis-specific methylesterase  46.42 
 
 
349 aa  294  2e-78  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.823717  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0174  chemotaxis-specific methylesterase  48.14 
 
 
360 aa  294  2e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.51198  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01854  chemotaxis-specific methylesterase  46.42 
 
 
349 aa  293  3e-78  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1757  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  46.69 
 
 
349 aa  293  3e-78  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.416964  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1749  chemotaxis-specific methylesterase  46.42 
 
 
349 aa  293  3e-78  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1301  chemotaxis-specific methylesterase  46.69 
 
 
349 aa  293  3e-78  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00345426 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01843  hypothetical protein  46.42 
 
 
349 aa  293  3e-78  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.80551  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1979  chemotaxis-specific methylesterase  46.42 
 
 
349 aa  293  3e-78  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2454  chemotaxis-specific methylesterase  46.7 
 
 
349 aa  293  5e-78  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.699312  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1930  chemotaxis-specific methylesterase  44.04 
 
 
355 aa  291  9e-78  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0087  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  43.4 
 
 
377 aa  291  9e-78  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.515449  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1516  chemotaxis-specific methylesterase  47.56 
 
 
350 aa  291  9e-78  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1859  chemotaxis-specific methylesterase  47.85 
 
 
350 aa  291  1e-77  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2846  chemotaxis-specific methylesterase  47.84 
 
 
360 aa  291  2e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0177184  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0261  chemotaxis-specific methylesterase  47.84 
 
 
360 aa  291  2e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.100544  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0243  chemotaxis-specific methylesterase  47.84 
 
 
360 aa  291  2e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.347664  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1205  chemotaxis-specific methylesterase  46.4 
 
 
349 aa  290  3e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2132  chemotaxis-specific methylesterase  46.4 
 
 
349 aa  290  3e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000304139 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2077  chemotaxis-specific methylesterase  46.4 
 
 
349 aa  290  3e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000138075 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2072  chemotaxis-specific methylesterase  46.4 
 
 
349 aa  290  3e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.959311  hitchhiker  0.000931228 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1328  chemotaxis-specific methylesterase  46.4 
 
 
349 aa  289  4e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000107644 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1564  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  48.07 
 
 
355 aa  289  6e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.736792  normal  0.583275 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2607  chemotaxis-specific methylesterase  47.56 
 
 
350 aa  287  2e-76  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.701564  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5612  chemotaxis-specific methylesterase  45.76 
 
 
356 aa  285  1.0000000000000001e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.147106  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0600  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheB methylesterase  47.9 
 
 
349 aa  285  1.0000000000000001e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0625  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  47.9 
 
 
349 aa  283  2.0000000000000002e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.291443  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0758  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheB methylesterase  38.98 
 
 
376 aa  283  4.0000000000000003e-75  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0634  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  47.9 
 
 
349 aa  283  4.0000000000000003e-75  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0170  chemotaxis-specific methylesterase  46.4 
 
 
363 aa  283  5.000000000000001e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.425756 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3693  chemotaxis-specific methylesterase  45.71 
 
 
357 aa  281  2e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0236536  normal  0.0240822 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00415  chemotaxis-specific methylesterase  41.14 
 
 
348 aa  279  5e-74  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0665  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  44.19 
 
 
343 aa  279  7e-74  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.518023  normal  0.470947 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1403  chemotaxis-specific methylesterase  45.95 
 
 
381 aa  277  2e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.551695  normal  0.0191361 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2020  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheB methylesterase  46.55 
 
 
354 aa  275  7e-73  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0978  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheB methylesterase  42.2 
 
 
352 aa  274  2.0000000000000002e-72  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0732  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  44.19 
 
 
350 aa  273  5.000000000000001e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.298385  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2969  chemotaxis-specific methylesterase  46 
 
 
367 aa  272  6e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000910724 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>