162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_1536 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007493  RSP_1536  hypothetical protein  100 
 
 
134 aa  270  6e-72  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0187  dehydratase  98.51 
 
 
134 aa  266  5.9999999999999995e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.771388 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21310  hypothetical protein  30 
 
 
156 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.288859  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1822  hypothetical protein  30.77 
 
 
156 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2748  MaoC domain protein dehydratase  33.06 
 
 
140 aa  76.6  0.0000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.149372  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2239  dehydratase  30.89 
 
 
138 aa  75.5  0.0000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.12703  normal  0.929294 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5194  dehydratase  31.85 
 
 
154 aa  72.8  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.477522  normal  0.0490486 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0193  dehydratase  34.43 
 
 
136 aa  72.4  0.000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0611  dehydratase  32.76 
 
 
147 aa  71.6  0.000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.519544  normal  0.134756 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4051  dehydratase  33.05 
 
 
140 aa  71.2  0.000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.46056  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5970  MaoC domain protein dehydratase  31.11 
 
 
155 aa  71.2  0.000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0874793  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3797  dehydratase  34.17 
 
 
132 aa  71.2  0.000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1596  MaoC domain protein dehydratase  32.48 
 
 
149 aa  71.2  0.000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.733518  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1081  dehydratase  33.33 
 
 
135 aa  71.2  0.000000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1255  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  32.28 
 
 
473 aa  70.5  0.000000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1493  dehydratase  29.75 
 
 
156 aa  70.5  0.000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0447243  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3371  MaoC domain-containing protein  30.33 
 
 
141 aa  70.1  0.00000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0588  MaoC-like dehydratase  33.9 
 
 
147 aa  69.7  0.00000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00165454 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2915  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  31.5 
 
 
473 aa  69.7  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3753  MaoC domain protein dehydratase  32.23 
 
 
157 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0985458  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3444  dehydratase  32.23 
 
 
157 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.523272  normal  0.0613814 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4044  MaoC-like dehydratase  27.82 
 
 
155 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.738131  normal  0.82003 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3256  MaoC domain protein dehydratase  37.33 
 
 
137 aa  68.6  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.157915 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2693  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  31.5 
 
 
473 aa  68.6  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1940  MaoC-like dehydratase  33.08 
 
 
146 aa  67.8  0.00000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6351  MaoC-like dehydratase  29.01 
 
 
144 aa  67.8  0.00000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.040058  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3661  dehydratase  34.45 
 
 
148 aa  67.4  0.00000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.831738  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3886  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  33.6 
 
 
464 aa  67  0.00000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.271652  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3364  MaoC-like dehydratase  33.88 
 
 
147 aa  66.6  0.0000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.975509  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0994  dehydrogenase  36.05 
 
 
134 aa  66.2  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0580228  normal  0.116886 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0584  dehydratase  30.89 
 
 
180 aa  66.6  0.0000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3847  dehydratase  26.56 
 
 
156 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0206  dehydratase  32.46 
 
 
133 aa  65.9  0.0000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2811  dehydratase  30.66 
 
 
152 aa  64.3  0.0000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.894889 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5041  dehydratase  32.48 
 
 
157 aa  63.9  0.0000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0522475  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1127  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  35.23 
 
 
472 aa  63.9  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.345508 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1672  MaoC-like dehydratase  38.55 
 
 
146 aa  63.5  0.0000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0444565  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1356  (de)hydratase  33.62 
 
 
141 aa  63.9  0.0000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4059  dehydratase  25.98 
 
 
156 aa  63.9  0.0000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3315  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  42.11 
 
 
470 aa  63.5  0.0000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.287925  normal  0.745735 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4100  MaoC-like domain protein  25.98 
 
 
173 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4356  MaoC-like dehydratase  27.64 
 
 
156 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2305  MaoC family protein  33.04 
 
 
147 aa  62.8  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1026  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  35.23 
 
 
472 aa  63.2  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0980  dehydratase  33.04 
 
 
147 aa  62.8  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.528408  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2195  dehydratase  33.04 
 
 
147 aa  62.8  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4552  MaoC domain protein dehydratase  25.98 
 
 
156 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.228955  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1205  dehydratase; 3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  31.09 
 
 
147 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3467  MaoC-like dehydratase  29.84 
 
 
145 aa  62  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.273532  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2964  MaoC-like dehydratase  29.06 
 
 
144 aa  62.8  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.139293  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2974  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  30.58 
 
 
473 aa  62.4  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.530032  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1998  MaoC-like dehydratase  29.69 
 
 
184 aa  62.8  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1337  dehydratase  25.98 
 
 
156 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.574177  normal  0.282303 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2926  putative MaoC-like dehydratase  29.91 
 
 
147 aa  62.8  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.997708  normal  0.0377556 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1226  maoC family protein  31.09 
 
 
147 aa  61.6  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1203  dehydratase; 3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  31.09 
 
 
147 aa  61.6  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0121  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  33.33 
 
 
476 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2215  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  30.58 
 
 
468 aa  61.6  0.000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3838  MaoC-like dehydratase  26.83 
 
 
156 aa  61.6  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1401  maoC family protein  31.09 
 
 
147 aa  61.6  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5047  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  39.47 
 
 
471 aa  61.6  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1058  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  33.33 
 
 
467 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1326  MaoC family protein  31.09 
 
 
147 aa  61.6  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3642  MaoC domain protein dehydratase  32.23 
 
 
157 aa  61.6  0.000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.023327 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0671  dehydratase  33.94 
 
 
127 aa  61.6  0.000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0318034  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1286  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  33.33 
 
 
467 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2798  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  33.33 
 
 
467 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2655  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  33.33 
 
 
467 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0145  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  33.33 
 
 
467 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.880803  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1364  maoC family protein  31.09 
 
 
147 aa  61.6  0.000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.168458  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2482  dehydratase  31.36 
 
 
150 aa  62  0.000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0895902  normal  0.157878 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1466  maoC family protein  31.09 
 
 
147 aa  61.6  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3980  maoC family protein  31.09 
 
 
147 aa  61.6  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2187  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  30.58 
 
 
468 aa  61.2  0.000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6218  dehydratase  30 
 
 
177 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1039  dehydratase  31.09 
 
 
147 aa  61.2  0.000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3533  MaoC domain protein dehydratase  40 
 
 
138 aa  60.8  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1355  acyl dehydratase  28.69 
 
 
142 aa  60.5  0.000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1594  dehydratase  28.33 
 
 
161 aa  60.8  0.000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.691822  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30160  3-Re enoyl-CoA hydratase PhaJ  25.78 
 
 
156 aa  60.1  0.000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4316  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  41.46 
 
 
481 aa  60.1  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.122938 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4426  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  41.46 
 
 
481 aa  60.1  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1753  dehydratase  38.1 
 
 
133 aa  60.1  0.00000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.674213  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0417  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  37.35 
 
 
467 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0357  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  36.67 
 
 
467 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.465716  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1284  MaoC-like dehydratase  35.71 
 
 
318 aa  59.3  0.00000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1227  dehydratase  30.51 
 
 
179 aa  59.3  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1425  maoC family protein  30.25 
 
 
147 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6753  dehydratase  26.87 
 
 
156 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.478036  normal  0.607095 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3568  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  36 
 
 
500 aa  57.8  0.00000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0052  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  35.63 
 
 
468 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.70674  normal  0.03837 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2202  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  28.46 
 
 
467 aa  57.4  0.00000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.878399 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3284  dehydratase  28.1 
 
 
158 aa  57.8  0.00000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.904701 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1674  MaoC domain-containing protein dehydratase  28.23 
 
 
134 aa  57.4  0.00000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0430305 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3596  dehydratase  36.84 
 
 
150 aa  57.4  0.00000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1055  dehydratase  32.97 
 
 
144 aa  57  0.00000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2329  MaoC domain protein dehydratase  27.42 
 
 
134 aa  56.6  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.676407  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6099  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  36.84 
 
 
482 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.249001  normal  0.018881 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1242  acyl dehydratase  23.93 
 
 
142 aa  55.8  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13048  predicted acyl dehydratase  31.4 
 
 
140 aa  56.2  0.0000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.620286  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>