23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_1990 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_1990  transposase and inactivated derivative  100 
 
 		 59 aa  117  6e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00339678  normal  0.576927 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0557  transposase IS4 family protein  75.44 
 
 		 458 aa  89.4  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.000649319  normal  0.755449 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2276  transposase IS4 family protein  71.19 
 
 		 450 aa  88.2  3e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0328  transposase IS4 family protein  71.19 
 
 		 450 aa  88.2  3e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.127689 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2267  transposase IS4 family protein  71.19 
 
 		 450 aa  88.2  3e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5124  IS4 family transposase  66.1 
 
 		 457 aa  82  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4905  IS4 family transposase  66.1 
 
 		 457 aa  82  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.24611 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2767  IS4 family transposase  66.1 
 
 		 457 aa  82  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3050  IS4 family transposase  66.1 
 
 		 457 aa  82  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000789979 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1054  transposase IS1182 family protein  59.32 
 
 		 458 aa  79.3  0.00000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.61591  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0495  transposase IS1182 family protein  59.32 
 
 		 458 aa  79.3  0.00000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00324095 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3223  transposase, IS4 family protein  67.31 
 
 		 460 aa  66.2  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.379638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3878  transposase IS4 family protein  64.58 
 
 		 460 aa  63.5  0.0000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.726843 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4079  transposase IS4 family protein  64.58 
 
 		 460 aa  63.5  0.0000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0888192 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3682  transposase IS4 family protein  64.58 
 
 		 460 aa  63.5  0.0000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.399219  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6639  transposase IS4 family protein  60.87 
 
 		 460 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4639  transposase IS4 family protein  60.87 
 
 		 460 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0787998  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4611  transposase IS4 family protein  60.87 
 
 		 460 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.239615  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3346  transposase IS4 family protein  60.87 
 
 		 460 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3057  transposase IS4 family protein  60.87 
 
 		 460 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0927  transposase IS4 family protein  60.87 
 
 		 460 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8073  transposase IS4 family protein  60.87 
 
 		 460 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0818  transposase and inactivated derivative  75 
 
 		 224 aa  51.2  0.000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.149498  hitchhiker  0.00134243 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>