30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_4882 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_4882  hypothetical protein  100 
 
 		 64 aa  122  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5234  hypothetical protein  84.38 
 
 		 64 aa  107  8.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.13626  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1138  hypothetical protein  68.75 
 
 		 64 aa  92.8  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0928  hypoxia induced protein region  84.38 
 
 		 79 aa  87  7e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0817  hypoxia induced protein region  84.38 
 
 		 76 aa  87  9e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.962231 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4204  hypothetical protein  65.08 
 
 		 65 aa  86.7  1e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3483  hypothetical protein  71.88 
 
 		 65 aa  84.3  5e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0751  hypothetical protein  68.75 
 
 		 64 aa  74.3  0.0000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4007  hypothetical protein  53.97 
 
 		 65 aa  65.1  0.0000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2957  hypoxia induced protein region  69.09 
 
 		 61 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2162  hypothetical protein  54.39 
 
 		 64 aa  63.9  0.0000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.241821  normal  0.380203 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3851  hypothetical protein  50.85 
 
 		 67 aa  63.5  0.0000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.571493 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0148  hypothetical protein  70.45 
 
 		 64 aa  62.4  0.000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1679  hypoxia induced protein region  65.31 
 
 		 61 aa  61.6  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4850  hypoxia induced protein region  61.82 
 
 		 61 aa  62  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.784963  normal  0.144066 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3558  hypothetical protein  53.45 
 
 		 67 aa  61.6  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.128976  normal  0.644683 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1790  hypothetical protein  64.58 
 
 		 53 aa  60.8  0.000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.000379179  normal  0.096262 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1818  Hypoxia induced protein conserved region  67.31 
 
 		 61 aa  61.2  0.000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.224413  normal  0.151751 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1538  hypoxia induced protein region  67.31 
 
 		 61 aa  61.2  0.000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.14295 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2529  hypothetical protein  53.97 
 
 		 67 aa  56.6  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.677101 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1050  hypothetical protein  46.67 
 
 		 65 aa  52.4  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.474983  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1612  hypoxia induced protein region  63.16 
 
 		 63 aa  51.2  0.000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.901174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1901  hypothetical protein  51.11 
 
 		 67 aa  51.2  0.000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.963466  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3030  hypothetical protein  67.57 
 
 		 66 aa  50.8  0.000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.448488  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3814  hypothetical protein  64.86 
 
 		 62 aa  50.4  0.000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0475962 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1705  Hypoxia induced protein conserved region  73.53 
 
 		 61 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1976  hypothetical protein  48.89 
 
 		 55 aa  47.8  0.00005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1006  hypothetical protein  52.5 
 
 		 67 aa  45.8  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2356  hypoxia induced protein region  48.21 
 
 		 68 aa  42.4  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.43014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1486  hypothetical protein  48 
 
 		 61 aa  41.6  0.003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>